在法律层面上，目前并没有明确的条款直接规定在商品房内存放骨灰为违法行为，但这一行为涉及多个法律与道德层面的问题，需全面分析：
物权法角度：
- 商品房业主对其房屋享有占有、使用、收益和处分的权利。从这一角度看，存放骨灰理论上可以被视为对房屋的一种使用方式。
- 但重要的是，这种使用方式必须遵守相关法律法规，且不得侵犯其他业主的合法权益。例如，如果存放骨灰的行为导致房屋价值贬损、影响其他业主的正常生活或造成心理不适，那么这种行为就可能构成对其他业主权益的侵犯。
伦理道德与社会风俗角度：
- 将骨灰存放在居住性质的商品房内，很可能与社会大众普遍接受的伦理道德观念和风俗习惯相冲突。在中国传统文化中，对于骨灰的处理有着特定的习俗和礼仪，居民楼内存放骨灰可能引发邻里关系紧张和其他业主的不满。
- 这种违背公序良俗的行为，不仅可能影响社区和谐，还可能导致法律纠纷。例如，其他业主可能会以侵犯相邻权为由提起诉讼，要求停止侵害、排除妨碍或赔偿损失。
小区管理规定与合同条款角度：
- 小区的管理规定或商品房买卖合同中往往包含关于房屋使用方式的限制条款。这些规定或条款可能明确禁止将房屋用于存放骨灰等特定用途。
- 因此，在考虑此类行为时，必须仔细审查相关管理规定和合同条款。如果违反了这些规定或条款，就可能构成违约行为，需要承担相应的违约责任。
法律建议：
- 鉴于可能引发的法律纠纷、社会矛盾以及违反管理规定的风险，我建议谨慎对待在商品房内存放骨灰的行为。
- 在考虑这样做之前，强烈建议先了解并遵守当地的相关法律法规、小区管理规定以及商品房买卖合同中的条款。
- 同时，也鼓励寻找更为合适、尊重传统的方式来处理骨灰问题，如选择专门的骨灰存放场所或遵循当地的丧葬习俗，以维护社区的和谐与稳定。
可能后果：
- 如果未经其他业主同意或违反小区管理规定在商品房内存放骨灰，可能会面临其他业主的投诉、起诉或要求赔偿等法律后果。
- 此外，这种行为还可能对房屋的价值产生负面影响，导致房屋难以出售或出租。
总结：虽然法律上没有明确规定禁止在商品房内存放骨灰，但鉴于可能引发的多种问题，我建议避免这样做。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。