刑事案件不起诉是否会留下案底，主要取决于不起诉的具体类型及案情。以下是对这一问题的详细分析：
法定不起诉（绝对不起诉）
- 情形：包括情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的；经特赦令免除刑罚的；依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；犯罪嫌疑人、被告人死亡的；以及其他法律规定免予追究刑事责任的。
- 案底情况：由于犯罪嫌疑人的行为本身不构成犯罪或依法不应追究刑事责任，因此不会留下案底。
酌定不起诉（相对不起诉）
- 情形：犯罪嫌疑人的犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的。
- 案底情况：虽然犯罪嫌疑人的行为构成了犯罪，但由于情节轻微等原因不需要判处刑罚或免除刑罚，一般情况下不会留下案底。然而，需要注意的是，在某些特定系统内，如涉及特殊行业就业背景审查等，可能会留下相关记录，但这些记录并不等同于通常意义上的“案底”。此外，部分地区对于符合特定条件的酌定不起诉案件，会探索进行案底封存等特殊处理方式，以减少对当事人的不利影响。
证据不足不起诉（存疑不起诉）
- 情形：对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的。
- 案底情况：存疑不起诉是基于证据不足无法认定犯罪嫌疑人有罪而作出的决定，按照“疑罪从无”的原则，一般不会留下案底。但若未来有新的证据出现，案件可能重新被审视，最终确定构成犯罪的，则可能会留下案底。
特殊情况说明：
- 在某些特定情况下，如涉及国家安全、特定行业就业背景审查等特殊情形，司法机关或相关单位可能会对个人的涉法情况进行更为细致的审查。此时，即使是不起诉的决定，相关记录也可能被作为参考，但这并不等同于通常意义上的“案底”。
- 对于酌定不起诉和证据不足不起诉的案件，虽然一般情况下不会留下案底，但当事人仍需注意可能的后续影响，如在特定领域的就业或社会评价方面。
总结与建议：
- 刑事案件不起诉是否会留下案底，需根据具体的不起诉类型及案件情况来判断。
- 在大多数情况下，法定不起诉和无违法犯罪事实的不起诉不会留下案底；而酌定不起诉和证据不足不起诉虽然一般也不会直接留下案底，但在某些特定情境下可能留有相关记录。
- 如果你或你身边的人面临类似情况，建议详细了解不起诉的具体类型及可能的影响，以便做出适当的应对。如有任何疑问或需要更详细的法律咨询，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。