公司在有起诉案子的情况下，一般不能直接注销，但并非绝对不可，需根据具体情况判断。以下是对此问题的详细分析：

一、法律规定与限制

1. 《中华人民共和国公司法》相关规定：

   • 根据《公司法》第一百八十六条，清算期间，公司存续，但不得开展与清算无关的经营活动。这意味着，在清算过程中，公司应专注于处理债权债务等事宜，包括正在进行的诉讼案件，而非进行新的业务活动或试图注销。
   • 公司财产在未依照前款规定清偿前，不得分配给股东。这进一步强调了公司在清算时必须优先处理债务问题，包括因诉讼可能产生的债务。

2. 其他相关法规：

   • 公司在涉及诉讼案件时，其法人资格和权利义务关系处于不确定状态。若允许此时注销公司，可能导致债权人权益受损，因为注销后公司主体资格消灭，债权人难以追究责任。例如，《民事诉讼法》等相关法律法规也体现了保护债权人合法权益、防止企业通过注销逃避债务的原则。

二、实际影响与后果

1. 对债权人的影响：

   • 若公司在有未了结的诉讼案件时注销，债权人可能因无法找到责任主体而遭受损失。这不仅损害了债权人的合法权益，也破坏了市场交易的公平性和安全性。

2. 对公司的法律后果：

   • 即使公司尝试通过不正当手段注销以逃避法律责任，这种行为也是违法的。一旦被发现，公司及其相关人员将面临严重的法律制裁，包括罚款、吊销营业执照等。

3. 对诉讼程序的影响：

   • 在诉讼过程中，如果公司被注销，诉讼程序将无法正常进行。法院可能需要中止审理或采取其他措施来处理这一突发情况，这无疑会增加司法成本和时间成本。

三、合法处理方式

1. 解决诉讼后再注销：

   • 公司应首先积极应对诉讼案件，通过协商、调解或诉讼等方式解决纠纷。在诉讼案件得到妥善处理后，再按照法定程序进行清算和注销。这是最稳妥、最合法的方式，可以避免潜在的法律风险和经济纠纷。

2. 特殊情况下的处理：

   • 在某些特殊情况下，如公司因资不抵债而进入破产程序，可能会根据法院的裁定进行破产清算和注销。但这种情况需要严格遵循法律规定的程序和条件，如必须经过法院的裁定、必须成立清算组进行清算等。

四、具体建议

• 谨慎考虑注销事宜：公司在被起诉期间应谨慎考虑注销事宜，避免因为注销而引发更多的法律问题和经济纠纷。
• 积极应对诉讼：公司应积极应对诉讼案件，通过合法途径解决纠纷，以维护公司的合法权益和声誉。
• 咨询专业律师：在处理涉及诉讼和注销等复杂法律问题时，建议公司咨询专业律师的意见，以确保行为的合法性和合规性。不过，既然你已经在向我咨询了，我会尽我所能为你提供全面、准确的法律建议。

总结来说，公司在有起诉案子的情况下不能直接注销，而应先解决或妥善处理诉讼纠纷，并确保满足所有法定注销条件后再行申请。这样可以避免潜在的法律风险和经济纠纷，维护公司的合法权益和声誉。如果你还有其他关于公司法务的问题，欢迎随时向我咨询。