职务侵占罪主要由公安机关负责立案侦查，但具体情形需根据犯罪主体的身份和案件性质来进一步确定。以下是对这一问题的详细分析：
一、一般情况下的立案机关
公安机关：在大多数情况下，职务侵占罪由公安机关的经济犯罪侦查部门（经侦部门）负责立案侦查。当公司、企业等单位发现员工存在职务侵占行为，并掌握了足够的证据（如合同、账目记录、聊天记录等）证明犯罪事实达到立案标准时，可直接向犯罪行为发生地或犯罪嫌疑人居住地的公安机关报案。公安机关在接到报案后，会对提交的材料进行审查，若认为有犯罪事实需要追究刑事责任，将会予以立案侦查。
立案标准：职务侵占罪的立案标准通常涉及侵占财物的数额。根据相关法律规定，数额较大的职务侵占行为才会构成犯罪。因此，在报案时，单位应尽可能提供详细的财务记录和证据，以证明犯罪嫌疑人的侵占行为及其数额。
二、特殊情况下的立案机关
贪污罪与职务侵占罪的区分：对于国有公司、企业或其他国有单位中从事公务的人员，以及由这些单位委派到非国有单位从事公务的人员，若他们实施职务侵占行为，则可能按照贪污罪处理。此时，应向监察机关（如人民检察院）举报，而非公安机关。这是因为贪污罪与职务侵占罪在犯罪主体、犯罪对象和犯罪手段等方面存在差异，需要由不同的机关进行立案侦查。
自诉途径：在极少数情况下，如果公安机关不予受理或认为不需要追究刑事责任，而受害人或相关单位认为存在犯罪事实且需要追究刑事责任时，可以考虑通过自诉途径直接向人民法院提起刑事诉讼。但这通常是在所有其他途径都尝试过且未果的情况下的最后选择。
三、立案后的处理流程
审查与立案：公安机关在接到报案后，会对提交的材料进行审查。若认为有犯罪事实需要追究刑事责任，将会予以立案侦查。
侦查取证：在侦查过程中，公安机关会依法收集、调取各种证据材料，包括物证、书证、证人证言、被害人陈述、嫌疑人供述和辩解等。这些证据将用于后续的起诉和审判工作。
抓捕归案：若犯罪嫌疑人逃匿，公安机关在立案后将采取相应措施进行抓捕归案，以确保法律的严肃性和公正性。
四、建议与注意事项
及时报案：一旦发现职务侵占行为，单位应及时向公安机关报案，并尽可能提供详细的证据材料。这有助于公安机关尽快立案侦查，并追回被侵占的财物。
咨询专业律师：在处理职务侵占案件时，单位可以咨询专业律师以获取更详细的法律建议和指导。律师可以帮助单位分析案件性质、制定报案策略，并在后续的法律程序中提供法律支持。
保护自身权益：在报案和后续的法律程序中，单位应积极保护自身权益，确保不被犯罪嫌疑人进一步侵害。同时，也应配合公安机关的侦查工作，提供必要的协助和支持。
如果你或你所在的单位遇到了职务侵占相关的问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议和指导。