结论前置：公路客运车辆超过额定乘员将面临罚款、记分、扣留机动车，甚至可能面临刑事处罚和吊销相关证件等严重后果。具体处罚依据超载的严重程度而定。

详细分析：

1. 罚款处罚：

   • 超过额定乘员未达20%：根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关法规，将处二百元以上五百元以下罚款。
   • 超过额定乘员20%以上未达50%：罚款金额提升至五百元以上二千元以下。
   • 超过额定乘员50%以上未达100%，以及超过100%以上：同样处五百元以上二千元以下罚款。但需注意，对于运输单位，如果其车辆经处罚后仍不改正超载行为，将对直接负责的主管人员处二千元以上五千元以下罚款，甚至可能面临更严厉的处罚，如停业整顿或吊销道路运输经营许可证。

2. 记分处理：

   • 超过额定乘员未达20%：依据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，一次记3分。
   • 超过额定乘员20%以上未达50%：一次记6分。
   • 超过额定乘员50%以上未达100%：一次记9分。
   • 超过额定乘员100%以上：一次记12分，即扣满全部分数，驾驶员需重新参加交通安全法律、法规和相关知识考试。

3. 扣留机动车：

   • 无论超载程度如何，公安机关交通管理部门均有权扣留超载车辆至违法状态消除，即需将超载的乘客转运，确保车辆乘员符合额定标准后方可放行。

4. 刑事处罚：

   • 如果公路客运车辆超载行为情节严重，构成犯罪，如导致严重交通事故等，还可能面临刑事处罚，包括可能的监禁等更严重的法律后果。

5. 吊销相关证件：

   • 若因超载发生重大交通事故并构成犯罪，将依法追究刑事责任，并由公安机关交通管理部门吊销机动车驾驶证。
   • 对于运输单位，如果其车辆一年内因超载被处罚两次以上，还将面临吊销道路运输经营许可证的处罚。

其他重要说明：

• 超载不仅涉及经济处罚和驾驶证记分，更关乎道路交通安全和乘客的生命财产安全。超载会严重影响车辆的操控性能和制动效果，增加发生交通事故的风险。
• 在实际执法过程中，公安机关交通管理部门会严格要求违法驾驶人或运输企业消除违法状态，即转运超载的乘客，以确保行车安全。

总结与建议： 公路客运车辆超载是严重的交通违法行为，不仅将面临罚款、记分、扣留机动车等处罚，还可能构成犯罪，面临刑事处罚和吊销相关证件等严重后果。因此，我强烈建议所有驾驶人和运输企业务必遵守相关法律法规，严禁超载行驶，共同维护良好的道路交通秩序和保障乘客的生命财产安全。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。