离职时，工资通常应当一次性结清，但具体还需根据实际情况和双方约定来确定。以下是对这一问题的详细分析：

一、法律规定需一次性结清的情形

根据《工资支付暂行规定》第九条，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。这一规定旨在确保劳动者在离职时能够及时获得应得的劳动报酬，避免生活上的困难和经济上的损失。同时，多地的地方性法规，如《广东省工资支付条例》等，也进一步细化和明确了这一要求，强调在终止或解除劳动关系当日结清并一次性支付劳动者工资。

二、特殊情况或约定情形的处理

尽管法律有明确规定，但在实际操作中，也可能存在一些特殊情况或用人单位与劳动者之间的特别约定，导致工资无法立即一次性结清：

1. 工资核算存在争议：如对加班时间、绩效奖金计算方式等有分歧，可能无法当场完成准确核算。在这种情况下，用人单位应与劳动者进行协商，确定一个合理的支付期限，并明确告知劳动者延迟支付的原因和预计支付时间。
2. 财务流程等客观原因：因财务流程等客观原因，用人单位无法立即支付工资。同样，用人单位应与劳动者进行协商，确定支付期限，并确保在合理期限内支付工资。
3. 双方特别约定：如果用人单位与劳动者在劳动合同或规章制度中明确约定了工资结算的方式和时间，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么双方可以按照约定执行。但即使有这样的约定，也不能违背在合理期限内支付工资的原则。如果约定的支付时间过长，严重损害了劳动者的合法权益，这种约定可能会被认定为无效。

三、劳动者权益保障

如果用人单位未按规定一次性结清工资，劳动者有多种合法途径维护自身权益：

1. 与用人单位协商：首先尝试通过沟通解决问题，要求用人单位支付拖欠的工资。
2. 向劳动监察部门投诉：若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉，请求其介入调查并督促用人单位支付工资。
3. 申请劳动仲裁：如问题仍未解决，劳动者可申请劳动仲裁，要求用人单位支付工资及相应的经济补偿。在申请劳动仲裁时，劳动者需要提供劳动合同、工资条、考勤记录等相关证据来支持自己的主张。

四、企业声誉与运营影响

用人单位不一次性结清工资，不仅可能引发劳动者与用人单位之间的纠纷，还可能对企业的声誉和正常运营造成负面影响。因此，建议用人单位严格遵守相关法律法规，确保在劳动者离职时及时、足额支付工资。

总结与建议：离职时工资是否应一次性结清，主要遵循相关法律法规的规定。在特殊情况下，双方可协商确定支付时间和方式，但必须确保劳动者的合法权益不受侵害。作为劳动者，在离职时应与用人单位明确工资结算的方式和时间，并保留好相关证据以备不时之需。如果用人单位未按规定支付工资，劳动者应依法维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。