公司害怕职业病鉴定的原因主要有以下几点：

1. 经济赔偿责任：一旦员工被鉴定为职业病，公司需要承担其长期的治疗费用，包括药物治疗、康复治疗等，这些费用往往高昂且持续。此外，公司还需按工伤赔偿标准支付一次性伤残补助金、伤残津贴、停工留薪期工资等，这对公司财务构成重大压力。若职业病病情恶化或引发其他并发症，公司还可能需承担额外费用，并面临劳动争议和法律纠纷的风险。

2. 法律责任与声誉损失：若公司未能提供足够的安全和健康措施导致员工患职业病，可能面临员工的法律诉讼和监管部门的处罚，包括罚款、责令停产整顿等。同时，职业病案例的曝光会损害公司在消费者、合作伙伴及公众中的形象，影响市场地位和业务发展，也可能影响公司的人才吸引和储备。

3. 员工士气与稳定性：职业病的出现会降低其他员工的工作积极性和士气，担心自身健康受到威胁。频繁的职业病问题和相关的法律纠纷还可能导致员工离职率上升，影响员工队伍的稳定性。

4. 行政监管压力：职业病案例会引发监管部门的更严格审查和监管，增加公司的运营成本和管理难度。公司需投入更多资源以应对频繁的监管检查，若公司在职业健康管理方面存在漏洞，还可能面临监管部门的严厉处罚，如高额罚款、停产整顿等，直接影响公司的正常生产经营。

5. 品牌形象与市场地位：职业病问题的曝光会损害公司的品牌形象，使客户、投资者和公众对公司的信任度降低。这可能导致客户流失、合作伙伴减少，进而影响公司的市场份额和业务发展。

员工申请职业病鉴定时需要注意的事项包括：

1. 及时申请：员工在发现自己可能患有职业病时，应及时向公司提出申请，并按照公司或相关部门的指引进行职业病鉴定。拖延时间可能导致病情恶化，增加鉴定和治疗的难度。

2. 保留证据：员工应保留与职业病相关的所有证据，包括工作记录、医疗记录、与公司的沟通记录等。这些证据在后续的职业病鉴定和赔偿过程中将起到关键作用。

3. 了解流程：员工应了解职业病鉴定的具体流程，包括申请、鉴定、复议等环节。这有助于员工更好地维护自己的权益，避免在鉴定过程中因不了解流程而错过重要时机。

4. 寻求专业帮助：在申请职业病鉴定和后续赔偿过程中，员工可以寻求专业律师或相关机构的帮助。他们可以提供专业的法律意见和指导，帮助员工更好地维护自己的权益。

5. 保持沟通：员工应与公司保持沟通，及时了解职业病鉴定的进展和结果。若公司存在拖延或拒绝鉴定的情况，员工可以向相关部门投诉或寻求法律援助。

作为贺介玉律师，我建议你在面对职业病鉴定和赔偿问题时，务必保持冷静和理性，及时寻求专业帮助，以维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。