针对您提出的“公司车辆违章但司机已离职，该如何处理违章”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，处理公司车辆违章，关键在于明确违章的责任主体以及处理违章的具体流程。尽管司机已经离职，但违章行为是在其在职期间发生的，因此，从法律责任的角度来看，司机仍然是违章行为的直接责任人。不过，在实际操作中，由于司机已经离职，公司可能需要采取一些额外的步骤来处理这些违章。

处理步骤如下：

1. 确认违章信息：

   • 公司应首先通过“交管12123”手机APP或访问当地公安部互联网交通安全综合服务管理平台（网站域名为“地方字母码.122.gov.cn”），查询并确认车辆的违章信息，包括违章时间、地点、违章行为以及罚款金额等。

2. 联系离职司机：

   • 尽管司机已离职，但公司应尝试与其取得联系，告知其违章情况，并要求其配合处理。这可以通过电话、邮件或书面通知等方式进行。
   • 如果司机愿意配合，可以指导其通过“交管12123”APP或前往线下交管窗口处理违章。

3. 公司代为处理：

   • 如果无法联系到司机或司机拒绝配合，公司可以考虑代为处理违章。这通常需要公司准备相关材料，如车辆行驶证、公司营业执照副本、授权委托书（如果需要）以及违章处理通知书等。
   • 对于可以在“交管12123”APP上处理的违章（如警告或罚款200元以下、记分6分（含）以下的非现场违法），公司可以注册并登录该APP，按照提示完成违章处理流程。
   • 对于罚款超过200元、记分超过6分或为现场处罚的违章，公司需要前往线下交管窗口进行处理。在处理时，应向工作人员说明情况，并提供相关材料。

4. 后续管理：

   • 处理完违章后，公司应更新车辆管理记录，确保违章信息得到及时清除。
   • 同时，公司应加强对在职司机的交通安全教育，提高他们的交通安全意识，减少类似违章行为的发生。

注意事项：

• 在处理违章时，请确保提供的所有材料都是真实有效的，以避免因材料问题导致的处理延误或失败。
• 如果公司选择代为处理违章，应确保有明确的授权和内部流程，以避免因处理不当而引发的法律纠纷。
• 对于频繁发生违章的车辆或司机，公司应进行深入调查和分析，找出问题根源并采取相应措施加以解决。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您在处理过程中遇到任何问题或需要进一步的帮助，请随时联系当地交管部门或咨询专业法律人士。