客车关闭GPS的处罚依据主要来源于《中华人民共和国安全生产法》以及地方性的道路运输管理条例。以下是对这一问题的详细解答：

一、国家层面的法律依据

根据《中华人民共和国安全生产法》第三十六条第三款的规定：

“生产经营单位不得关闭、破坏直接关系生产安全的监控、报警、防护、救生设备、设施，或者篡改、隐瞒、销毁其相关数据、信息。”

若客车驾驶员或客运企业故意关闭GPS等直接关系生产安全的监控设备，即违反了上述法律规定。依据《中华人民共和国安全生产法》第九十九条第(四)项的规定，对于此类违法行为，将给予责令限期改正，并处五万元以下的罚款；若逾期未改正，则处五万元以上二十万元以下的罚款，同时对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员处一万元以上二万元以下的罚款；情节严重的，还可能责令停产停业整顿；若构成犯罪，则将依照刑法有关规定追究刑事责任。

二、地方层面的法律依据（以四川省为例）

除了国家层面的法律外，各地还可能根据本地实际情况制定地方性的道路运输管理条例。以《四川省道路运输条例》为例，其第六十二条第五项明确规定：

“客货运输经营者、驾驶员未按规定使用卫星定位系统的，由县级以上道路运输管理机构责令改正，并处以二千元以上五千元以下的罚款；情节严重的，由原许可机关依法吊销相关经营许可和从业资格证件。”

这一规定同样适用于客车关闭GPS等卫星定位系统的行为。

三、处罚裁量的考虑因素

在具体处罚时，交通执法机关会综合考虑违法行为的事实、性质、社会危害程度等因素，对照当地的交通运输行政处罚裁量标准进行裁量。例如，若客车驾驶员或客运企业是首次违法，且未造成事故或其他危害后果，且按期完成了整改，那么处罚可能会相对较轻。

四、案件启示

客车安装GPS等卫星定位系统是为了加强道路运输车辆的动态监督管理，预防和减少道路运输安全事故。人为关闭这些系统会导致车辆脱离动态监督管理，增加道路运输安全事故的风险。因此，为了保障人民群众的生命和财产安全，客运企业和驾驶员必须严格遵守相关法律法规，确保GPS等安全设备的正常运行。

综上所述，客车关闭GPS的处罚依据主要来源于《中华人民共和国安全生产法》以及地方性的道路运输管理条例。对于此类违法行为，交通执法机关将依法进行处罚，以维护道路运输市场的秩序和安全。