在机动车与非机动车发生交通事故且双方负有同等责任的情况下，赔偿问题确实需要综合考虑多个因素，包括交强险、商业险以及责任比例等。以下是对这一问题的详细解答：

一、赔偿原则与法律依据

首先，根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条，机动车发生交通事故造成人身伤亡、财产损失的，由保险公司在机动车第三者责任强制保险（即交强险）责任限额范围内予以赔偿。这是赔偿的首要原则，不区分责任比例。

二、交强险范围内的赔付

1. 赔偿限额：

   • 死亡伤残赔偿限额：18万元
   • 医疗费用赔偿限额：1.8万元
   • 财产损失赔偿限额：0.2万元

2. 赔付方式：

   • 在交强险范围内，无论机动车与非机动车的责任比例如何，保险公司都会全额承担非机动车方的损失，直至达到赔偿限额。

三、超出交强险部分的赔付

1. 责任比例：

   • 在双方同等责任的情况下，超出交强险赔偿限额的部分，一般由机动车一方承担60%的赔偿责任，非机动车一方承担40%的责任。但具体比例可能因地区而异，需参考当地司法实践。

2. 商业三者险的作用：

   • 如果机动车投保了商业三者险，超出交强险的部分将由保险公司根据保险合同进行赔偿。例如，若非机动车方产生5万元医疗费用，交强险赔付1.8万元后，剩余3.2万元按责任比例分担，若机动车方承担60%，则商业三者险需赔偿1.92万元。

3. 未投保商业三者险的情况：

   • 如果机动车未投保商业三者险，超出交强险的部分将由机动车方自行承担相应责任比例的赔偿。

四、非机动车方对机动车方的赔偿

• 在双方同责的情况下，非机动车方也需对机动车方的损失承担50%的赔偿责任。但由于非机动车方往往没有保险，这部分赔偿可能需要通过协商或法律途径解决。

五、具体赔偿项目与注意事项

1. 具体赔偿项目：

   • 医疗费用：包括挂号费、检查费、治疗费、药费等。
   • 财产损失：如车辆修理费等。
   • 伤残赔偿：如果造成非机动车方伤残，需根据伤残等级计算残疾赔偿金等相关费用。
   • 其他费用：如误工费、护理费、交通费、住院伙食补助费等。

2. 注意事项：

   • 在处理赔偿事宜时，双方应充分沟通、积极协商，确保赔偿的公平性和合理性。
   • 保留好相关证据，如事故现场照片、证人证言、医疗费用单据等，以支持自己的权益主张。
   • 如果双方对赔偿事宜无法达成一致，可以通过申请交警调解或向人民法院提起民事诉讼等法律途径来解决纠纷。

六、特殊情况处理

• 如果非机动车一方存在故意碰撞机动车等情形，机动车一方不承担赔偿责任。但这种情况需要有充分的证据来证明非机动车方的故意行为。

综上所述，机动车与非机动车发生交通事故且双方负同等责任时的赔偿问题是一个综合考量的过程。在处理此类事故时，应遵循相关法律法规，及时采取措施保护自己的合法权益，并通过协商或法律途径解决赔偿纠纷。