运载超限物品未按指定路线行驶的，将面临以下处罚：
行政处罚：
- 责令改正：公路管理机构或县级以上道路运输管理机构有权责令当事人立即停止违法行为，并按照指定的路线行驶，以确保公路设施的安全和道路运输的合法性。
- 罚款：根据《公路安全保护条例》及相关规定，运载超限物品未按指定路线行驶的，将面临罚款处罚。具体罚款金额可能因超限程度、违法情节等因素而有所不同，但通常包括一定数额的固定罚款，如200元至3000元不等，若存在违法所得，还将没收违法所得，并处以违法所得2倍以上10倍以下的罚款；若无违法所得或不足2万元，将处以3万元以上10万元以下的罚款。
- 扣留车辆：在严重情况下，公安机关交通管理部门有权依法扣留涉案车辆，直至车主或驾驶员提供有效的超限运输许可证或消除超限状态。
其他可能的法律后果：
- 警告：对于情节较轻的违法行为，相关部门可能给予警告处罚，以提醒车主或驾驶员遵守相关法律法规。
- 吊销驾驶证：如果运载超限物品未按指定路线行驶的行为严重违反了道路交通安全法规，且驾驶员存在重大过失或故意违法行为，相关部门可能吊销其驾驶证，以维护道路交通安全。
- 追究刑事责任：在极端情况下，如果运载超限物品未按指定路线行驶的行为造成了严重后果，如交通事故、公路设施损坏等，且驾驶员的行为构成犯罪，将依法追究刑事责任，可能涉及刑事拘留、有期徒刑等更严重的法律后果。
法律背景与建议：
- 超限运输车辆通行证的重要性：超限运输车辆通行证是一车一证的，仅限于本超限运输车辆在规定的时间、路线和速度进行道路运输使用。未经许可，不得擅自行驶公路。因此，车主或驾驶员在进行超限运输前，务必依法办理相关手续，并按照规定的时间和路线行驶。
- 地区实施细则的差异：不同地区可能根据本地实际情况，在法律规定的幅度范围内制定具体的实施细则和裁量标准。因此，车主或驾驶员在从事超限运输前，应了解并遵守当地的相关法律法规和实施细则。
- 预防与合规建议：为避免处罚和确保道路运输的安全与合法性，车主或驾驶员应定期检查车辆状态，确保车辆符合道路交通安全标准；同时，加强法律法规学习，提高法律意识，确保在进行超限运输时依法办理相关手续，并按照规定的时间和路线行驶。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。