结论：公司按60%基数缴纳社保是否合法需分情况讨论，关键看是否符合“工资与缴费基数一致”的强制性规定。以下是具体分析：
1. 若员工实际工资≥当地社平工资的60%，公司按60%缴纳违法
根据《社会保险法》及《社会保险费征缴暂行条例》，社保缴费基数应按员工上年度月平均工资确定，且不得低于当地社平工资的60%（下限），不得高于300%（上限）。
- 违法情形：若员工实际工资高于社平工资60%，但公司仍按60%的最低基数缴纳，属于“未足额缴纳社保”，员工可向当地社保部门投诉，要求公司补缴差额及滞纳金。
- 法律依据：《社会保险法》第60条明确规定“用人单位应当自行申报、按时足额缴纳社会保险费”，第62条赋予社保部门核查、责令补缴的权力。
2. 若员工实际工资＜当地社平工资的60%，公司按60%缴纳合法
若员工工资低于社平工资的60%（如试用期工资、低收入岗位），公司可按最低基数（60%）缴纳，此时不违法。
- 例外情形：若员工能证明公司通过“拆分工资”（如部分工资通过现金发放、报销形式规避社保）导致缴费基数降低，仍可主张公司违法。
- 实践建议：员工可要求公司提供工资明细及社保缴费记录，核对“工资总额”与“缴费基数”是否一致。
3. 公司按60%缴纳的潜在风险
即使短期合法，长期按最低基数缴纳可能引发以下问题：
- 员工权益受损：退休后养老金、医疗报销额度等与缴费基数挂钩，长期低缴会导致待遇降低；
- 公司法律风险：若被社保部门稽查，需补缴差额及滞纳金（日万分之五），甚至面临行政处罚；
- 劳动争议隐患：员工可能以“未足额缴纳社保”为由被迫解除劳动合同，并主张经济补偿金（需结合地方司法实践判断）。
4. 员工维权路径
若发现公司违法缴纳，可采取以下步骤：
- 与公司协商：要求调整缴费基数至实际工资水平；
- 向社保部门投诉：携带劳动合同、工资流水等证据，向当地社保局或税务局（部分地区社保征缴由税务部门负责）举报；
- 申请劳动仲裁：若以“未足额缴纳社保”为由解除合同，可主张经济补偿金（需注意部分地区要求先投诉补缴，仲裁才支持补偿）。
总结：公司能否按60%缴纳社保，核心取决于员工实际工资与社平工资的关系。若您遇到此类问题，可进一步提供具体工资数据及所在地区，我将帮您计算合法缴费基数范围，并制定维权方案。