员工扣绩效工资是否合法，主要取决于绩效考核制度的合法性、明确性，扣除比例的合理性，以及扣除后工资是否低于最低工资标准等多个因素。以下是对此问题的详细分析：

合法情况

1. 绩效考核制度合法且明确

   • 劳动合同或规章制度有明确约定：如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了绩效工资的考核标准、发放方式及扣减情形，并且这些规定经过了民主程序制定（如职工代表大会讨论通过），同时已向员工公示或告知，那么公司在员工绩效不达标时扣减绩效工资通常是合法的。例如，公司规定销售人员需完成特定销售业绩才能获得全额绩效工资，且这一规定已在员工入职时通过员工手册等方式明确告知。
   • 考核指标具体、程序合法：绩效考核制度内容应具体、清晰，考核程序应公正、合理，避免主观随意性大或模糊不清的指标。若员工未达到相应绩效标准，用人单位按制度扣减绩效工资是合法的。

2. 经济损失赔偿合法

   • 当员工因故意或重大过失给公司造成经济损失时，公司可按照劳动合同约定要求其赔偿。但赔偿的扣除需符合《工资支付暂行规定》，即每月扣除部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。例如，员工因疏忽导致公司货物损坏，公司可按照约定从其绩效工资中扣除相应赔偿，但扣除比例需合法。

3. 符合法定扣除情形

   • 用人单位在特定情况下可代扣劳动者工资，如代扣代缴的个人所得税、社会保险费用等。若扣除绩效工资属于这些法定情形之一，且符合相关法律规定，则扣除行为合法。

不合法情况

1. 绩效考核制度不合法或不明确

   • 如果绩效考核制度本身不合法，未经过民主程序制定，或考核标准模糊不清、随意变更，或未提前向员工公示告知，那么以绩效考核为由扣除工资是违法的。例如，公司未制定明确的绩效考核制度，却随意以绩效不达标为由扣减员工工资。

2. 无正当理由随意扣减

   • 公司无正当理由随意扣减员工的绩效工资，或以绩效之名行克扣工资之实（如为惩罚员工、强迫离职等恶意扣减），均属违法行为。例如，公司因员工拒绝加班而扣减其绩效工资。

3. 扣除后工资低于最低工资标准

   • 即使绩效考核制度合法，但如果扣除绩效工资后员工的实际工资低于当地最低工资标准，这种扣除也是违法的。最低工资标准是保障员工基本生活的法定底线，公司不得违反。

员工权益维护途径

若员工认为公司扣减绩效工资的行为不合法，可采取以下措施维护自身权益：

1. 与用人单位协商解决：员工首先应与用人单位沟通协商，了解扣减绩效工资的具体原因和依据，并表达自己的意见和诉求。

2. 向劳动行政部门投诉：若协商无果，员工可向当地劳动行政部门投诉，寻求政府部门的帮助和支持。

3. 申请劳动仲裁或提起诉讼：如问题仍无法解决，员工可向劳动仲裁机构申请仲裁，或在必要时向人民法院提起诉讼，通过法律途径来维护自身合法权益。

综上所述，员工扣绩效工资是否合法需综合考虑多个因素。作为员工，在面临此类问题时，应充分了解自己的权益和维权途径，并在必要时寻求法律帮助以确保自身权益不受侵害。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。