职务侵占罪一般由公安机关负责立案侦查，具体来说，是由公安机关的经济犯罪侦查部门（经侦部门）来处理。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：

一、立案机关的一般情况

1. 公安机关的职责：

   • 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十九条的规定，刑事案件的侦查主要由公安机关进行，职务侵占罪作为刑事案件的一种，自然也不例外。
   • 公安机关在接到报案后，会对提交的材料进行审查。若认为有犯罪事实需要追究刑事责任，将会予以立案侦查。

2. 报案流程：

   • 当公司、企业等单位发现员工存在职务侵占行为，并掌握了足够的证据（如合同、账目记录、聊天记录等）证明犯罪事实达到立案标准时，可直接向犯罪行为发生地或犯罪嫌疑人居住地的公安机关报案。
   • 报案时，应提供详细的案情描述、相关证据材料以及嫌疑人的基本信息等，以便公安机关进行初步审查。

二、立案机关的特殊情况

1. 贪污罪的特殊处理：

   • 对于国有公司、企业或其他国有单位中从事公务的人员，以及由这些单位委派到非国有单位从事公务的人员，若他们实施职务侵占行为，则可能按照贪污罪处理。
   • 在这种情况下，应向监察机关（如人民检察院）举报，而非公安机关。这是因为贪污罪涉及国家工作人员的职务廉洁性，其侦查和起诉程序与职务侵占罪有所不同。

2. 立案后的处理流程：

   • 无论是职务侵占罪还是贪污罪，一旦立案，公安机关或监察机关都会依法展开侦查工作，收集证据，查明事实真相。
   • 若犯罪嫌疑人逃匿，公安机关或监察机关在立案后将采取相应措施进行抓捕归案，以确保法律的严肃性和公正性。

三、注意事项与建议

1. 证据收集的重要性：

   • 在报案前，公司应尽可能收集全面、客观的证据材料，以证明犯罪事实的存在和犯罪嫌疑人的身份。这些证据将直接影响到案件的立案和侦查进程。

2. 选择正确的报案途径：

   • 对于不同性质的单位（如国有与非国有）和人员（如公务人员与非公务人员），其职务侵占行为的法律性质和立案机关可能有所不同。因此，在报案前，应仔细分析案件性质，选择正确的报案途径。

3. 寻求专业法律帮助：

   • 职务侵占罪的立案与处理是一个涉及多个法律环节和机关的复杂过程。为了更好地维护自身权益和追究犯罪者的法律责任，建议公司在面对此类问题时，寻求专业法律顾问的帮助。

综上所述，职务侵占罪一般由公安机关的经济犯罪侦查部门立案侦查。但在特殊情况下，如涉及贪污罪时，应向监察机关举报。在处理此类问题时，公司应充分了解相关法律法规和程序要求，确保报案的准确性和有效性。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。