针对厂房违建的处理方式，这是一个涉及城乡规划、土地管理以及行政强制执行等多方面法律法规的问题。以下是我从多个角度为您详细解析的处理流程与要点：

一、违法建筑的认定标准

1. 未取得建设工程规划许可证：在城乡规划区内进行厂房建设，若未取得相关规划许可或未按许可内容进行建设，均属违法行为。
2. 违反控制性详细规划：即使取得规划许可，但建设内容不符合控制性详细规划要求，同样构成违法。
3. 擅自改变使用性质：未经批准擅自将厂房改为其他用途，如居住或商业经营，也属于违法行为。

二、处理流程与措施

1. 立案调查

   • 相关部门（如城乡规划主管部门或城市管理综合行政执法部门）在接到举报或自行发现违建厂房后，应立即立案调查。
   • 调查过程中，会收集证据，包括现场勘查记录、询问笔录、相关证照等，以确认厂房是否属于违建。

2. 责令停止建设

   • 对正在建设的违建厂房，相关部门应立即责令停工，防止违法行为继续扩大。
   • 若当事人不配合，相关部门可采取查封施工现场、强制拆除部分已建结构等措施。

3. 作出处罚决定

   • 根据调查结果，相关部门会依法作出处罚决定。处罚措施可能包括罚款、限期拆除、没收违法所得等。
   • 处罚决定书会送达当事人，并告知其申请行政复议或提起行政诉讼的权利。

4. 执行处罚决定

   • 当事人应在规定期限内履行处罚决定，如自行拆除违建厂房或缴纳罚款。
   • 若逾期不履行，相关部门可依法申请人民法院强制执行，包括强制拆除违建厂房。

5. 后续监管

   • 相关部门会加强对厂房建设活动的日常巡查和监管，防止新的违建产生。
   • 同时，会建立违建档案，对处理情况进行跟踪记录。

三、特殊情形下的处理原则

1. 历史遗留问题：对于因历史原因形成的违建厂房，相关部门会结合当地政策进行妥善处理。可能涉及补办手续、部分拆除或保留观察等措施。
2. 公共利益考量：在处理过程中，相关部门会充分考虑公共利益因素，避免简单“一刀切”导致资源浪费或社会不稳定。例如，对于某些对公共利益影响不大的违建厂房，可能会采取罚款或没收违法所得等较轻的处罚措施。

四、法律依据

• 《中华人民共和国城乡规划法》：明确规定了违法建筑的认定标准和处理程序。例如，第六十四条规定，对于未取得或未按建设工程规划许可证建设的，县级以上地方人民政府城乡规划主管部门可责令停止建设，并根据情况采取限期改正、限期拆除、没收实物或违法收入等措施。
• 《中华人民共和国土地管理法》：对非法占用土地进行建设的行为进行了规范。例如，第七十七条规定，非法占用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还土地，限期拆除新建物，恢复土地原状；符合土地利用总体规划的，没收新建物并可并处罚款。
• 《中华人民共和国行政强制法》：规定了行政机关对违法的建筑物、构筑物、设施等需要强制拆除的程序和要求。例如，第四十四条规定，对违法的建筑物需要强制拆除的，应当由行政机关予以公告，限期当事人自行拆除；逾期不拆且不申请行政复议或提起行政诉讼的，行政机关可以依法强制拆除。

五、综合建议

1. 依法依规建设：企业和个人在建设厂房前，务必依法依规办理相关手续，确保建设活动符合城乡规划和土地管理要求。
2. 积极配合调查：若厂房被认定为违建，当事人应积极配合相关部门的调查和处理工作，避免违法行为继续扩大或产生更严重的法律后果。
3. 寻求法律帮助：在处理违建厂房问题时，若遇到法律难题或不确定如何处理，建议及时向我咨询，以便获得专业的法律指导和帮助。

希望以上解答能对您有所帮助。如果您在厂房违建处理方面还有其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。