虚开发票是一种严重的违法行为，它不仅损害了国家的税收利益，也破坏了市场的公平竞争环境。针对虚开发票的处理，通常涉及税务和法律两个层面，下面我将结合具体案例，为您详细阐述虚开发票的一般处理流程及后果。

一、税务层面的处理

1. 税务稽查与立案： 税务部门在发现企业存在虚开发票的嫌疑后，会依托税收大数据分析等手段进行深入调查，并依法立案。例如，在黑龙江霍李会计代理有限公司的案例中，税务部门就是通过数据分析发现其涉税数据存在风险，进而展开立案调查的。

2. 证据收集与核实： 税务稽查人员会依法调取企业的对公账户银行流水、企业账簿资料等，通过资金流向交叉比对核查，确认是否存在虚开发票的行为。同时，还会实地核验企业的实际经营情况，如存货账实是否相符等。在白城市衡冠建筑材料批发中心的案例中，税务部门就是通过比对发票信息、会计账簿以及实地核验等方式，发现了其虚开发票的违法事实。

3. 处理处罚决定： 一旦确认企业存在虚开发票的行为，税务部门会依据相关法律法规作出处理处罚决定。这通常包括追缴税费款、加收滞纳金，并处以罚款。在霍李公司的案例中，税务部门对其作出了追缴税费款、加收滞纳金并处罚款共计20.58万元的处理处罚决定。

二、法律层面的处理

1. 移交公安机关： 如果虚开发票的行为涉嫌犯罪，税务部门会将相关线索移交公安机关进一步侦办。在霍李公司的案例中，涉嫌虚开发票犯罪线索就已被移交公安机关。

2. 刑事处罚： 对于构成犯罪的虚开发票行为，司法机关会依法追究刑事责任。在白城市衡冠建筑材料批发中心的案例中，实际控制人王杏辉就因犯虚开增值税专用发票罪被依法判处有期徒刑三年，缓刑四年，并处罚金人民币5万元。

三、虚开发票的后果

1. 经济损失： 企业需要承担追缴的税费款、滞纳金以及罚款等经济损失，这往往是一笔不小的数目。

2. 声誉损害： 虚开发票的行为会严重损害企业的声誉和形象，影响其在市场上的竞争力和合作伙伴的信任。

3. 法律责任： 企业及其相关责任人可能面临刑事处罚，包括有期徒刑、罚金等，这将对其个人和企业的未来产生深远影响。

四、建议与提醒

1. 遵守法律法规： 企业应严格遵守国家税收法律法规，不得进行任何形式的虚开发票行为。

2. 加强内部管理： 企业应建立健全的内部管理制度，加强对发票等财务凭证的管理和审核，确保业务的真实性和合法性。

3. 积极配合税务稽查： 如果企业被税务部门稽查，应积极配合并提供相关证据和资料，以便税务部门尽快查明事实真相。

总之，虚开发票是一种严重的违法行为，企业应坚决杜绝此类行为的发生。一旦被发现存在虚开发票的行为，将面临严重的税务和法律后果。因此，建议企业加强内部管理，遵守法律法规，共同维护市场的公平竞争环境。