结论前置：
- 一般情况下，每天上班超过12小时是不合法的。
- 但在特定情况下，如经过劳动行政部门批准的特殊工时制度、紧急特殊情况或劳资双方协商并得到审批，可能合法。
详细分析：
一、一般情况下不合法
根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条的规定，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。这是保障劳动者休息权益、维护其身体健康的基本法律原则。因此，在常规情况下，要求员工每天上班超过12小时，明显超出了法定工作时间，属于违法行为。
二、特定情况下可能合法
特殊工时制度：
- 不定时工作制：对于因工作性质和生产特点不能实行标准工时制度的企业，如高级管理人员、外勤人员、推销人员等，经劳动行政部门批准，可以实行不定时工作制。在这种制度下，企业可不执行每日工作不超过8小时的规定。
- 综合计算工时工作制：同样，对于需要连续作业的特殊行业，如交通、铁路、邮电、水运、航空、渔业等，经劳动行政部门批准，可以实行综合计算工时工作制。在综合计算周期内，虽然某一具体日（或周）的实际工作时间可能超过8小时（或40小时），但整个周期内的总实际工作时间不应超过总法定标准工作时间。
紧急特殊情况：
- 在发生自然灾害、事故或其他威胁劳动者生命健康和财产安全的情况下，或者生产设备、交通运输线路、公共设施发生故障且必须及时抢修时，根据《劳动法》第四十二条，延长工作时间可以不受上述法定限制。这是为了应对突发状况、保护公共利益和劳动者安全而做出的特殊规定。
劳资双方协商与审批：
- 虽然不常见，但在某些情况下，如果劳资双方就工作时间进行了协商，并且得到了劳动行政部门的批准，那么即使工作时间超过了法定限制，这种安排也可能是合法的。但这需要严格的审批程序和双方的明确同意，且必须确保不损害劳动者的身体健康和合法权益。
三、劳动者权益保护
- 如果用人单位违反工时规定，强制要求员工长时间工作并未按规定支付相应薪资，劳动者有权拒绝超过法定工作时间的工作安排，并有权要求用人单位支付加班费或进行相应的补偿。
- 劳动者可通过与用人单位协商解决争议，协商不成时，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自身权益。
四、法律建议
- 对于劳动者：应充分了解自己的工作时间权益，如果发现自己的工作时间超过了法定限制，且不符合上述任何特殊情况或特殊规定，应及时与用人单位沟通，要求其改正并支付相应的加班工资。如果协商不成，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 对于用人单位：应严格遵守相关法律法规，合理安排员工的工作时间和休息时间，确保工时安排的合法性和合理性。如果因生产经营需要延长工作时间，应确保符合法律规定并经过相应审批程序。
法律依据：
- 《中华人民共和国劳动法》第三十六条：国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。
- 《中华人民共和国劳动法》第四十一条：用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。
- 《中华人民共和国劳动法》第四十二条：有下列情形之一的，延长工作时间不受本法第四十一条规定的限制：（一）发生自然灾害、事故或者因其他原因，威胁劳动者生命健康和财产安全，需要紧急处理的；（二）生产设备、交通运输线路、公共设施发生故障，影响生产和公众利益，必须及时抢修的；（三）法律、行政法规规定的其他情形。
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