员工删除公司资料，在特定情况下是可以报警的。具体来说：
一般情况下不建议报警：对于仅删除的未经过加密处理且对实际运营影响较小的后台数据，例如那些属于个人娱乐性质的非商业性数据，通常并不建议采取报警措施。因为这可能属于公司内部管理问题，可以通过内部规章制度或民事途径解决。
特定情况下应报警：若员工删除的是公司或个人至关重要的后台数据，并可能给他人的生产经营构成实质性的破坏，如导致公司业务中断、客户流失或经济损失等，则应当选择报警。此时，删除数据的行为可能构成犯罪，如破坏计算机信息系统罪，根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，此类行为的被告将有可能被判处三年以下有期徒刑、拘役或者管制；情节特别严重者，则可能会被判处三年以上七年以下有期徒刑。
因此，在员工删除公司资料的情况下，公司应首先评估数据的重要性及删除行为对公司运营的实际影响，再决定是否报警。同时，公司也应加强内部数据安全管理，防止类似事件再次发生。如果你对此类问题有进一步的疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。