您好，关于因公殉职的认定部门，这主要取决于具体的情况和地区政策。一般来说，对于国家机关工作人员因公牺牲的确认，通常是由其所在单位或地区参照相关法规进行办理的。

以一般性的规定为例，根据《民政部关于国家机关工作人员伤亡抚恤工作有关问题的通知》精神，国家机关工作人员因公牺牲的确认，会参照《军人抚恤优待条例》的有关规定来执行。这意味着，认定过程可能会涉及到对死亡原因、是否在执行公务期间等关键因素的审查。

而在一些地区，如贵港市，就出台了具体的《市直机关单位工作人员因公牺牲认定办法》。根据该办法，贵港市市直机关工作人员因公牺牲的认定工作是由一个专门的工作组来负责的，这个工作组由市委组织部、市民政局、财政局、人力资源社会保障局、卫生健康委、退役军人事务局等多个部门组成。他们共同负责因公牺牲的认定事宜，确保认定的公正性和准确性。

具体来说，如果机关单位工作人员死亡符合因公牺牲的情形，如执行公务中或上下班途中因意外事件死亡、因公致残后旧伤复发死亡、患职业病导致死亡等，其所在单位会提出申请，并经过审查确认后，报给市因公牺牲认定工作组进行复核。复核通过后，会出具《因公牺牲证明书》，并发给因公牺牲工作人员的遗属。

因此，因公殉职的认定部门并不是单一的，而是根据具体情况和地区政策来确定的。如果您或您身边的人遇到了这样的情况，建议先咨询所在单位或当地的相关部门，了解具体的认定流程和所需材料，以便能够顺利地进行认定申请。