摩托车闯红灯的处罚为：记6分，罚款200元。以下从法律依据和特殊情形两个角度进行详细分析：

1. 法律依据
   根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》第十条第八项规定，驾驶机动车不按交通信号灯指示通行的，一次记6分。同时，依据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条，违反交通信号灯通行的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。实践中，摩托车作为机动车范畴，通常按上限200元处罚。

2. 特殊情形说明

   • 地方性法规差异：部分城市可能结合本地交通管理需求，在法定幅度内调整罚款标准（如深圳对摩托车闯红灯罚款500元），但需以当地公开的处罚标准为准。
     
   • 情节加重情形：若闯红灯导致交通事故，除记分罚款外，还可能承担事故主要或全部责任，并面临《刑法》中交通肇事罪的刑事风险。
     
   • 证据认定标准：电子警察抓拍的违法照片需清晰显示摩托车车牌及驾驶人面部特征，否则可通过行政复议申请撤销处罚。

建议：驾驶摩托车时务必提前观察信号灯变化，通过路口时减速慢行。若已发生闯红灯行为，可通过”交管12123”APP查询违法记录详情，对处罚有异议的可在收到决定书60日内申请行政复议或6个月内提起行政诉讼。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体处理流程。