在楼顶安装太阳能热水器（这里假设您主要关注的是类似光伏发电板这样的设备安装，虽然太阳能热水器与光伏发电板在功能上有所不同，但安装合法性的考量因素有相似之处）的合法性，主要取决于几个关键因素：是否符合当地政策规定、是否办理了相关备案审批手续，以及安装的具体方式和高度等是否符合技术规范。

首先，从政策层面来看，许多地区都鼓励和支持新能源的使用，包括太阳能。因此，在符合一定条件下，楼顶安装太阳能热水器或光伏发电板是被允许的。但具体政策会因地区而异，所以您需要先了解您所在地区的具体政策要求。

其次，安装前通常需要向相关部门进行备案或审批。这通常是为了确保安装活动符合城市规划、建筑安全、消防安全等方面的要求。例如，在某些地区，您可能需要向街道城建部门或相关能源管理部门提交安装申请，并提供必要的资料，如安装方案、安全评估报告等。

再者，安装的具体方式和高度等也需要符合相关技术规范。这主要是为了确保安装活动不会对建筑结构造成损害，不会影响建筑的外观和安全性，同时也不会对周边环境造成不良影响。例如，安装高度可能有限制，以确保不会超出建筑物的合理轮廓线；安装方式可能需要考虑防水、防风等因素。

以您提供的参考信息为例，在楼顶安装光伏发电板需要符合《深圳市分布式光伏发电项目管理操作办法》等有关要求，包括安装高度、结构形式等方面的规定。如果未经备案审批或不符合技术规范进行安装，就可能被视为违法建设，面临被拆除或处罚的风险。

因此，我建议您在安装太阳能热水器前，先了解您所在地区的具体政策要求，并向相关部门咨询备案审批流程和技术规范。在确保符合所有要求的前提下，再进行安装活动，以确保合法性和安全性。