关于设施农用地是否可以建厂房的问题，这需要根据具体的土地类型、使用目的以及是否遵循了相关法律法规和审批流程来判断。以下是对此问题的详细解答：

一、土地类型与用途管制

首先，我们需要明确土地的类型和用途管制。在我国，土地主要分为农用地、建设用地和未利用地。农用地主要用于农业生产，而建设用地则用于建设厂房、住宅等。设施农用地，作为农用地的一种，其用途是受到严格限制的，主要用于农业生产设施、附属设施及配套设施的建设，以服务于农业生产和直接相关活动。

二、设施农用地建厂房的合规性

1. 与农业生产直接相关的厂房：

   • 如果厂房的建设目的与农业生产直接相关，例如用于农产品的烘干、储存等小型厂房，且按照规定办理了审批手续，那么在设施农用地上建设是可能的。
   • 这种情况下，需要向当地农业农村部门和自然资源部门提出申请，经过审核、规划许可等一系列法定程序，获得批准后方可动工。

2. 非农业生产用途的厂房：

   • 如果厂房的建设用于非农业生产的工业生产、商业经营等用途，那么这属于擅自改变土地用途，是违反土地管理法律法规的。
   • 特别是对于基本农田，我国法律有明确规定，禁止任何单位和个人在基本农田保护区内进行建房（包括建厂房）等活动。

三、审批流程与法律后果

1. 审批流程：

   • 无论厂房建设是否与农业生产直接相关，都需要经过严格的审批流程。这包括向相关部门提出申请、提交必要的材料、经过审核和规划许可等步骤。
   • 只有获得批准后，方可进行厂房的建设。

2. 法律后果：

   • 如果未经批准擅自改变土地用途，将面临县级以上人民政府自然资源主管部门的责令改正、罚款等法律后果。
   • 在严重情况下，还可能承担刑事责任。

四、实际操作建议

• 在计划于设施农用地上修建厂房前，务必咨询当地自然资源主管部门或专业律师，了解具体的政策法规、申请流程及限制条件。
• 确保建设项目符合土地利用总体规划，并严格按照审批要求进行建设和使用，以避免不必要的法律风险和经济损失。

综上所述，设施农用地上能否修建厂房取决于具体的使用目的和是否依法办理了审批手续。如果厂房建设与农业生产直接相关且符合审批要求，那么是可以在设施农用地上建设的；否则，将面临法律责任。因此，在做出决策前，请务必咨询相关部门或专业人士的意见。