针对您提出的“单位撤销合并后档案如何处理”的问题，这是一个涉及档案管理法规与实际操作流程的重要事项。以下是我根据相关法律法规和实际操作经验，为您提供的详细解答：

一、法律法规依据

1. 《中华人民共和国档案法》：该法第十六条规定，机关、团体、企业事业单位和其他组织发生机构变动或者撤销、合并等情形时，应当按照规定向有关单位或者档案馆移交档案。

2. 《机关档案管理规定》(国家档案局第13号令)：该规定第五十四条详细说明了机关撤销或合并时档案的移交办法，包括撤销机关的档案应由有关主管机关代管或向同级国家综合档案馆移交；一个机关并入另一个机关或几个机关合并为一个新的机关时，其档案应移交给合并后的机关代管或向同级国家综合档案馆移交等。

3. 《各级各类档案馆收集档案范围的规定》(国家档案局第9号令)：该规定第六条指出，国有企业发生破产转制，事业单位发生撤销等情况，其档案可按照有关规定由本级综合档案馆接收。

4. 《中华人民共和国档案法实施条例》：该条例也明确了已撤销单位的档案可以提前向有关的国家档案馆移交，并规定了档案形成单位或移交单位撤销、合并、职权变更时的档案处理责任。

二、档案处理流程

1. 成立档案工作领导小组：在单位撤销合并前，应成立专门的档案工作领导小组，负责研究和规划档案的移交接收工作。

2. 明确专人负责：指定专人负责档案的整理、清点、移交等工作，确保在机构改革过程中档案不丢失、不损坏。

3. 清点档案数量：对单位内的所有档案进行全面清点，包括纸质档案、电子档案等，确保档案的完整性和准确性。

4. 整理规范档案：按照档案管理的相关规定，对档案进行整理、分类、编号、装订等，确保档案的规范性和易查性。

5. 移交档案：

   • 对于属于档案馆接收范围的档案，应及时整理规范并移交综合档案馆保管。
   • 对于不属于档案馆接收范围的档案，应整理规范后移交主管部门或者新成立单位的综合档案室保管。

6. 形成长效机制：在档案移交完成后，应建立长效机制，继续做好档案的管理、利用等后续工作，确保档案的长期保存和有效利用。

三、注意事项

1. 遵守法律法规：在处理档案时，必须严格遵守相关法律法规的规定，不得擅自销毁、转移或隐匿档案。

2. 确保档案安全：在档案整理、移交过程中，应采取必要的安全措施，确保档案的安全性和完整性。

3. 及时沟通协调：在档案移交过程中，应与接收单位保持密切沟通协调，确保档案的顺利移交和接收。

4. 做好记录留存：对档案的处理过程应做好详细记录，包括档案的清点、整理、移交等情况，以备后续查阅和审计。

综上所述，单位撤销合并后的档案处理是一项复杂而重要的工作，必须严格按照相关法律法规的规定进行操作，确保档案的完整性、安全性和长期保存。希望以上解答能对您有所帮助。如有其他疑问或需要进一步了解相关流程，请随时咨询。