结论：闪电贷本金结清后，违约金是否还会被起诉，这主要取决于贷款合同中的具体约定以及贷款机构的选择。以下从不同角度进行详细分析：
合同约定角度：
- 违约金条款的存在：首先，需要查看贷款合同中是否明确约定了违约金的支付条件和金额。如果合同中有明确的违约金条款，并且借款人确实存在违约行为（如逾期还款、提前还款等），那么贷款机构有权根据合同约定要求借款人支付违约金。
- 本金结清与违约金的关系：本金结清并不意味着所有债务都已清偿。如果合同中规定违约金是独立于本金之外的债务，那么即使本金已经结清，贷款机构仍然有权要求借款人支付违约金。
贷款机构的选择角度：
- 起诉的决策：贷款机构是否选择起诉借款人支付违约金，取决于多种因素，包括违约金的金额、借款人的还款能力、贷款机构的内部政策等。如果违约金金额较小，或者贷款机构认为起诉成本过高，可能会选择放弃起诉。
- 协商与和解：在实际情况中，贷款机构和借款人之间可能会进行协商，寻求和解方案。例如，贷款机构可能会同意减免部分违约金，或者允许借款人分期支付违约金，以避免法律诉讼。
法律后果角度：
- 法律责任：如果贷款机构选择起诉，并且法院认定借款人确实存在违约行为，那么借款人将需要承担法律责任，包括支付违约金和可能的诉讼费用。
- 信用影响：无论是否被起诉，借款人的违约行为都可能对其信用记录产生负面影响。这可能会影响借款人未来申请贷款、信用卡等金融产品的能力。
建议：
- 审查合同：借款人应仔细审查贷款合同中的违约金条款，了解自己的权利和义务。
- 积极沟通：如果借款人确实存在违约行为，并且担心被起诉支付违约金，建议积极与贷款机构沟通，寻求和解方案。
- 法律咨询：如果借款人对合同条款或法律后果存在疑问，建议咨询专业律师，以获取更具体的法律建议。
示例：假设某借款人与贷款机构签订了一份闪电贷合同，合同中明确约定了如果借款人提前还款，需要支付一定比例的违约金。后来，借款人提前还清了本金，但未支付违约金。此时，贷款机构有权根据合同约定要求借款人支付违约金。如果借款人拒绝支付，贷款机构可能会选择起诉借款人。因此，借款人在提前还款前应仔细审查合同条款，并考虑是否需要支付违约金。
总之，闪电贷本金结清后，违约金是否还会被起诉取决于多种因素。借款人应了解自己的权利和义务，并积极与贷款机构沟通，以避免不必要的法律纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。