结论：两次闯红灯被扣12分后，一般情况下不能直接通过学法减分来完全抵消这12分，但如果在处理完交通违法行为记录后，累积记分未满12分（即在一个记分周期内，除了这两次闯红灯的扣分外，没有其他扣分），且符合学法减分的其他条件，那么可以通过学法减分来减免部分记分，但一个记分周期内最多只能减免6分。
详细分析：
闯红灯的法律后果：
- 闯红灯是违反《道路交通安全法》的行为，根据相关规定，一次闯红灯通常会被记6分，并处以罚款。因此，两次闯红灯就会被记12分。
学法减分政策的基本条件：
- 根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，机动车驾驶人处理完交通违法行为记录后，若累积记分未满12分，且参加公安机关交通管理部门组织的交通安全教育并达到规定要求，可以申请在现有累积记分分值中扣减记分。
- 学法减分的方式包括线上学习考试、现场学习考试以及参加交通安全公益活动。
学法减分的限制情形：
- 在本记分周期内有二次以上满分记录，或累积记分已达到十二分的，不得申请学法减分。但这里的“累积记分已达到十二分”指的是在申请学法减分时，驾驶人的累积记分状态。如果驾驶人已经因为两次闯红灯被记了12分，但在处理完这些违法行为后（比如缴纳了罚款），且在一个记分周期内没有其他扣分，那么此时他的累积记分并未“持续”达到12分（因为记分周期会清零或重新计算，具体取决于记分周期的时间点和扣分时间），而是处于一个可以申请学法减分的状态（即未满12分，如果考虑的是下一个记分周期或者已经处理完当前周期的扣分后）。然而，更准确的理解是，如果驾驶人已经因为两次闯红灯被记了12分，并且这12分都来自当前记分周期，那么在他处理完这些违法行为并缴纳罚款后，虽然记分记录仍然存在，但他在当前记分周期内已经“用满”了12分，因此在当前记分周期内，他无法再通过学法减分来减免这12分中的任何部分（因为学法减分是在“累积记分未满12分”的前提下进行的）。但如果考虑的是下一个记分周期，或者驾驶人通过其他方式（如部分扣分被撤销或误记被纠正）使得在当前记分周期内实际累积记分未满12分，那么他就可以申请学法减分。
- 为了更清晰地解释这一点，我们可以这样理解：如果驾驶人在一个记分周期内因为两次闯红灯被记了12分，并且没有其他扣分，那么在他处理完这些违法行为后，他的驾驶证状态可能是“记满12分”或“暂扣”等，这取决于具体的记分周期时间和扣分时间。如果记分周期已经结束或即将结束，并且驾驶人已经接受了相应的处罚（如参加满分学习、考试等），那么在下一个记分周期开始时，他的累积记分会清零，此时他就可以在新记分周期内申请学法减分（当然，要满足其他条件）。如果记分周期尚未结束，且驾驶人尚未接受满分学习、考试等处罚，那么他需要先完成这些处罚程序，然后才能考虑学法减分的问题（但此时他已经“用满”了当前记分周期的12分，因此无法在当前周期内通过学法减分来减免这12分）。不过，从实际操作的角度来看，更常见的情况是驾驶人在被记满12分后，会先接受满分学习、考试等处罚，然后等待下一个记分周期的开始。
- 除了上述情况外，还有其他一些限制条件，如上一个记分周期内有二次以上满分记录的、最近三个记分周期内有严重违法行为的、驾驶证在实习期内或逾期未审验等情形的，也不得申请学法减分。
学法减分的减免额度：
- 即使驾驶人符合学法减分的条件，一个记分周期内也最多只能减免6分。这意味着，即使驾驶人通过学法减分减免了部分记分，他仍然需要承担因闯红灯而产生的部分法律后果（即至少会被记6分，如果两次闯红灯都发生在同一个记分周期内且没有其他减免情况的话）。
建议与提醒：
- 驾驶人应严格遵守交通规则，避免闯红灯等危险且违法的行为。遵守交通规则不仅关乎行车安全，还能有效避免不必要的麻烦和经济损失。
- 如果不慎违反了交通规则并被记分，驾驶人应及时处理交通违法行为记录，并了解自己的记分情况。如果符合学法减分的条件，可以积极申请以减免部分记分。
- 在申请学法减分时，驾驶人应仔细了解相关规定和限制条件，确保自己符合减免资格。同时，他也应认真参与交通安全教育和学习活动，提升自己的交通安全意识和法律素养。
如果有任何其他关于交通违章或学法减分的问题，可以直接向我咨询。