合同在一定条件下可以盖业务专用章，但需谨慎操作以确保合同效力。以下是对此问题的详细分析：
有效情况
符合公司规定：
- 若企业根据自身业务需求刻制了业务专用章，并在内部管理制度中明确规定了其使用范围包括合同签订，那么该业务专用章用于特定业务相关的合同签订是有效的。例如，一家贸易公司专门用于进出口业务合同签订的业务专用章，在使用范围内加盖于合同上，即代表公司的真实意思表示，合同有效。
交易习惯认可：
- 在某些行业或特定交易环境中，若存在长期形成的、被广泛认可的交易习惯，允许使用业务专用章签订合同，则此类合同通常也被认定为有效。比如，在某个特定的商品交易市场，商户们普遍使用业务专用章代替公章签订短期购销合同，且此做法被市场内各方接受，那么这样的合同也是有效的。
可能无效或存在争议的情况
超出使用范围：
- 若业务专用章被用于超出其规定使用范围的合同签订，其效力将受到质疑。例如，业务专用章仅用于货物收发业务，却在借款合同上加盖，此时合同效力存在争议，可能无法代表公司的真实意愿，对方可能会主张合同无效。
不能体现真实意思表示：
- 在欺诈、胁迫、盗用等情形下，即使合同上加盖了业务专用章，也可能因无法体现当事人的真实意思表示而被认定为无效或可撤销。比如，员工未经授权私自盗用公司业务专用章签订合同，公司发现后可主张合同无效，并追究员工的法律责任。
操作建议与风险防范
明确业务专用章的用途和使用范围：
- 在使用业务专用章前，务必确认其用途和使用范围是否与合同签订行为相符。这可以通过查阅公司内部管理制度或相关授权文件来实现。
完善内部管理制度：
- 企业应建立健全印章管理制度，明确各类印章的使用范围和权限，特别是业务专用章的使用应严格控制，避免滥用。同时，应定期对印章使用情况进行检查和审计，确保印章使用的合规性。
在签订合同时仔细核对印章类型：
- 在签订合同时，应仔细核对印章类型，确保使用正确的印章。若对印章类型有疑问或不确定，应及时向公司相关部门或法律顾问咨询。
对于涉及重大利益的合同，建议使用公章或合同专用章：
- 为了降低法律风险，对于涉及重大利益的合同，建议优先使用公章或合同专用章。这些印章在合同签订中的使用被广泛承认和接受，具有更高的法律效力。
及时咨询法律专业人士：
- 在合同履行过程中发生纠纷时，应及时向我这样的法律专业人士咨询，根据具体情况采取合适的法律措施，维护自身合法权益。
总结来说，合同在一定条件下可以盖业务专用章，但需确保符合公司规定及交易习惯，并能真实体现当事人意思表示。在使用过程中需谨慎操作，以避免不必要的法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。