结论前置：公司与员工协商一致解除劳动合同后，员工在特定条件下仍有权申请劳动仲裁。关键在于协商解除的过程及协议内容是否存在法律瑕疵、未履行的争议事项，以及是否遵守了仲裁时效的规定。以下是对此问题的详细分析：
一、可以申请仲裁的情形
存在欺诈、胁迫或乘人之危
- 法律解释：根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十六条，以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下订立或者变更劳动合同的，该劳动合同无效或者部分无效。
- 实例说明：若公司在与员工协商解除劳动合同时，隐瞒了关键信息（如即将发放的奖金）或利用员工的困境迫使其签订解除协议，员工有权在知道或应当知道撤销事由之日起一年内申请仲裁，请求撤销该协议，恢复劳动关系，或要求公司支付相应的赔偿。
协议内容存在重大误解或显失公平
- 法律解释：当协商解除的协议内容存在重大误解，即员工对协议的重要内容有错误认识，或者协议中的权利义务明显不对等、显失公平时，员工可以在一定期限内申请仲裁，请求变更或撤销该协议。
- 实例说明：如果公司利用员工对法律规定不熟悉，给予的经济补偿远低于法定标准，员工就有权提出仲裁，要求公司按法定标准支付经济补偿。
公司未履行协商内容
- 法律解释：若协商解除劳动合同后，公司未按照协议的内容履行相关义务，如未按时支付经济补偿金、加班工资或其他劳动报酬，员工可以通过仲裁来维护自己的权益。
- 实例说明：协议中明确约定了公司应支付的经济补偿金金额和支付时间，但公司未按约定支付，员工可以申请仲裁要求公司履行支付义务。
涉及未明确协商的劳动争议事项
- 法律解释：劳动争议受案范围包括因劳动合同订立、履行、变更、解除等发生的争议。若协商解除时未处理某些劳动争议事项，如加班工资、年休假补偿等，劳动者离职后可就此单独申请仲裁。
- 实例说明：协商解除劳动合同时，双方未就加班工资进行协商，员工离职后发现公司未支付加班工资，可以就此申请仲裁要求公司支付。
二、不可以申请仲裁的情形
- 法律解释：如果协商解除劳动合同是双方真实意愿的体现，且协议内容符合法律规定，不存在上述可撤销或争议的情形，并且双方已经按照协议履行了各自的义务，那么员工再申请仲裁通常不会被支持。
- 实例说明：双方平等自愿协商解除劳动合同，公司按约支付了经济补偿金，员工也办理了离职手续并签署了无其他争议声明，此时员工再申请额外补偿一般不会被支持。
三、仲裁时效
- 法律解释：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
- 实例说明：若员工在协商解除劳动合同后一年内发现公司存在未支付经济补偿金等违法行为，应及时申请仲裁以维护自己的权益。若超过一年时效期间再申请仲裁，可能会因超过时效而不予受理。
四、建议与指导
- 谨慎对待协商过程：员工在协商解除劳动合同的过程中应谨慎对待，确保自己的权益得到充分保障。对协商过程中的任何条款或条件有疑问或不确定因素时，应及时向我咨询以获取准确的法律建议和指导。
- 仔细阅读协议内容：员工在签订解除协议前应仔细阅读并理解协议的所有内容，特别是关于经济补偿、劳动报酬、加班工资等重要劳动权益的约定。发现协议中存在不公平或不合理的条款时，应及时提出并与公司进行协商修改。
- 及时采取行动：若员工认为自己的权益受到了侵害，应及时收集证据并在仲裁时效内向仲裁机构提起仲裁申请以维护自己的合法权益。
综上所述，公司与员工协商一致解除劳动合同后员工是否可以申请仲裁取决于具体的协商过程和协议内容以及是否存在违法或违约行为。员工应充分了解自己的权益和仲裁的相关规定以便在必要时采取适当的行动来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。