违建罚款中工程造价的认定，通常需结合实际成本、市场价格及行政机关的调查程序综合判定，具体认定方式如下：

1. 以实际成本为基础
   行政机关会首先核查违建的实际投入成本，包括材料费、人工费、机械费等直接费用。例如，若违建主体为砖混结构，需通过施工合同、采购发票、工人工资单等证据，确定每平方米的造价标准。若无法提供合法凭证，可能参考当地同类工程的平均成本或定额标准。

2. 参考市场价格与评估报告
   若实际成本难以查实（如无书面凭证或成本明显低于市场价），行政机关可能委托第三方评估机构，根据违建的建筑面积、结构类型、建筑材料等，结合当地市场价格出具评估报告。例如，钢结构违建的造价可能按每吨钢材价格、加工费、安装费等分项计算。

3. 结合行政调查程序
   认定过程需遵循法定程序，包括现场勘验、询问当事人、调取证据等。行政机关会制作《违法建设工程造价认定书》，明确造价构成、计算方法及依据，并告知当事人有权提出异议或申请重新评估。例如，若当事人对评估结果有争议，可要求行政机关出示评估机构的资质证明及计算明细。

4. 特殊情形的处理

   • 部分合法部分违建：若建筑部分合法、部分违建，需分别核算合法与违法部分的造价。例如，合法建筑加建的违建层，仅对加建部分造价进行认定。
     
   • 历史违建：对建成时间较长的违建，可能参考建造时的市场价格或定额标准，避免因时间跨度导致造价认定不合理。
     

提示：工程造价认定是违建罚款的关键环节，直接影响罚款金额。若对认定结果有异议，需在行政机关告知的期限内提出复核申请，并提交相反证据（如更低成本的采购合同、施工记录等）。如有具体案件，可进一步向我说明细节，我会结合证据分析认定程序的合法性及金额合理性。