结论：事业单位人员相对不起诉后，若行为违反行政法规且未过追责时效，行政机关仍可依法作出行政处罚。以下是对此问题的详细分析：
一、相对不起诉与行政处罚的关系
相对不起诉的定义：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十七条，对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。这被称为相对不起诉或酌定不起诉。
行政处罚的独立性：相对不起诉仅代表刑事程序的终结，并不否定行为的违法性。若该行为同时违反了行政法规，且未超过行政处罚的追责时效，行政机关仍有权依法作出行政处罚。这是因为刑事责任与行政责任是两种不同的法律责任，它们的承担并不互相排斥。
二、法律依据与适用条件
《刑事诉讼法》的相关规定：如前所述，相对不起诉是检察院根据犯罪情节轻微等情形作出的决定，但这并不影响行政机关对违法行为的行政处罚。
《行政处罚法》的衔接条款：根据《行政处罚法》第三十五条，违法行为构成犯罪，人民法院判处拘役或有期徒刑时，行政机关已给予行政拘留的应折抵刑期；法院判处罚金时，行政机关已罚款的应折抵罚金。这一条款反向解读即意味着，若未被追究刑事责任（如相对不起诉），则行政处罚不受此限制。
追责时效的考虑：根据《行政处罚法》第三十六条，违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚；涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，上述期限延长至五年。因此，在相对不起诉后，若违法行为未超过追责时效，行政机关仍可处罚。
三、实务操作要点
证据材料的移交：检察院作出相对不起诉决定后，应将案卷材料移送行政机关。行政机关需审查这些证据是否满足行政处罚的证明标准（通常低于刑事标准）。
处罚种类的选择：在作出行政处罚时，行政机关需考虑刑事程序中已采取的措施（如取保候审保证金）是否可抵扣部分罚款金额，并避免重复处罚。
典型案例参考：例如，某事业单位人员因虚开发票被移送起诉，但检察院认为情节轻微不起诉。随后，税务机关依据《税收征收管理法》对其处以罚款并加收滞纳金。
四、风险防范建议
对当事人：即使获得不起诉决定，仍需关注行政机关的后续动作。如有需要，可通过听证、陈述申辩等方式争取从轻处理。
对执法机关：建议建立“刑行衔接”信息共享平台，确保案件信息的及时传递和处罚的及时性。同时，定期清理长期悬而未决的案件，防止超期处罚。
总结：相对不起诉并非“免罚金牌”，而是将行为评价回归行政法律框架。在实践中，需把握“刑事优先但不替代行政”的原则，确保法律责任的全面实现。如果您或您身边的人遇到类似问题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议。