资金被司法机关冻结后，您应当按照以下步骤处理，具体分为不同情况说明：

1. 确认冻结主体与原因
   首先需明确冻结机关（如法院、检察院、公安机关）及冻结依据（如涉嫌刑事犯罪、民事执行、行政处罚等）。您可通过银行查询冻结机关名称及联系方式，或直接联系冻结机关要求出具《冻结通知书》，通知书中会载明冻结案由、期限及法律依据。
   例如：若因民事诉讼被冻结，可能涉及对方申请财产保全；若因刑事案件被冻结，可能涉及赃款追缴或证据保全。

2. 分析冻结合法性

   • 合法冻结：若冻结符合法定程序（如提供明确法律依据、履行通知义务等），您需配合调查，但可主张合法权益。
     
   • 违法冻结：若冻结机关未出具法律文书、超出法定范围（如冻结与案件无关资金）或期限（刑事冻结最长6个月，可续冻；民事保全最长1年），您可向冻结机关提出书面异议，或通过行政复议、行政诉讼等途径维权。
     法律依据：《刑事诉讼法》第145条、《民事诉讼法》第111条。

3. 根据案件类型采取应对措施

   • 刑事案件冻结：
     
     1. 配合调查：主动联系办案机关（如经侦支队），说明资金来源合法性（如提供合同、转账记录等），申请解除冻结或部分解冻。
        
     2. 申请退赔：若资金被认定为赃款，可争取通过退赔程序减少损失，但需以法院判决为准。
        
     3. 申诉控告：若冻结错误（如误冻），可向检察院申请立案监督，或向法院提起国家赔偿。
        
   • 民事案件冻结：
     
     1. 提供担保：向法院申请用等值财产（如房产、车辆）置换被冻结资金，以恢复资金流动性。
        
     2. 协商和解：与对方达成和解协议，由对方申请解除保全。
        
     3. 申请复议：对保全裁定不服的，可在收到裁定书5日内向作出法院申请复议。
        
   • 行政案件冻结：
     
     1. 履行义务：若因未缴纳罚款被冻结，及时补缴后可申请解冻。
        
     2. 行政复议/诉讼：对行政处罚决定不服的，可申请复议或提起诉讼，同时申请中止执行冻结。

4. 注意事项

   • 时效性：刑事冻结需在冻结期限内主张权利，民事保全需在复议期内提出异议。
     
   • 证据保留：保存所有与资金来源、用途相关的证据（如发票、聊天记录等），以备举证。
     
   • 避免二次风险：解冻前勿擅自转移资金，否则可能涉嫌“隐藏、转移财产”被追究责任。

总结建议：资金冻结后，首先通过合法途径确认冻结原因，再根据案件类型选择配合调查、提供担保、申请复议或诉讼等策略。若对程序或法律适用有疑问，可直接向我咨询，我会结合具体案情为您制定解决方案。