针对您提出的“犯罪嫌疑人有重大疾病怎么办”这一问题，我会从法律程序和实际操作两个层面为您详细解答。
一、法律程序层面的处理
强制措施的选择：
- 根据《刑事诉讼法》的相关规定，若犯罪嫌疑人患有重大疾病且生活不能自理，同时采取取保候审不致发生社会危险性，那么公安机关、人民检察院和人民法院可以决定对其适用取保候审措施。这通常要求犯罪嫌疑人提出保证人或交纳保证金。
- 若犯罪嫌疑人符合取保候审条件但无法提供保证人或保证金，司法机关可执行监视居住措施。监视居住应在犯罪嫌疑人的住处执行，无固定住处者可在指定居所执行，但需避免在羁押场所或专门办案场所执行。
医学评估与鉴定：
- 在对犯罪嫌疑人所患疾病的真实性或严重程度存疑时，司法机关会委托有资质的医学机构进行医学鉴定，以准确判断病情及其对诉讼活动的影响，进而决定后续处理方式。
审查起诉与审判阶段的处理：
- 在审查起诉阶段，人民检察院会根据案件情况和犯罪嫌疑人的身体状况，继续维持或重新决定取保候审、监视居住等措施。
- 在审判阶段，法院会根据案情和犯罪嫌疑人的健康状况，决定是否继续羁押，或变更为更宽松的强制措施。若犯罪嫌疑人因严重疾病无法到庭，法院可根据病情紧急程度、审理进展等，决定延期审理或在特殊场所（如病房）开庭审理。
刑罚执行与保外就医：
- 若犯罪嫌疑人被判处刑罚且患有严重疾病需要保外就医，根据《刑事诉讼法》的相关规定，可暂予监外执行。但需注意，有社会危险性或自伤自残的罪犯不得保外就医，且必须由省级人民政府指定的医院诊断并开具证明文件。
二、实际操作层面的建议
及时沟通与申请：
- 若犯罪嫌疑人或其家属发现犯罪嫌疑人患有重大疾病，应及时与办案机关沟通，并提供相关医疗证明。
- 根据病情和案件情况，及时向办案机关申请取保候审或监视居住等强制措施变更。
配合医疗救治：
- 在取保候审或监视居住期间，犯罪嫌疑人应积极配合医疗救治，确保得到妥善治疗。
- 同时，犯罪嫌疑人应遵守相关规定，如定期报到、不得离开指定区域等，以维护诉讼程序的顺利进行。
关注病情变化与证据固定：
- 在救治过程中，办案机关会持续关注犯罪嫌疑人的病情发展，并与医院保持密切沟通。
- 犯罪嫌疑人或其家属也应关注病情变化，并及时向办案机关提供相关医疗资料作为证据留存。
三、特殊情况的考虑
- 对于患有传染病或对他人健康构成威胁的疾病，司法机关在采取强制措施前会进行充分的医学评估和防疫措施，以防止疾病传播。
四、总结与提醒
尽管犯罪嫌疑人患有重大疾病，但这并不构成逃避法律制裁的理由。司法机关在处理此类案件时，会充分考虑其病情和实际情况，同时确保在法律框架内依法、公正地对其进行处理。因此，我建议您或犯罪嫌疑人家属积极与办案机关沟通，配合医疗救治和诉讼程序，以维护犯罪嫌疑人的合法权益和诉讼程序的顺利进行。