结论前置：分居起诉离婚的流程包括准备诉讼材料、确定管辖法院并提交诉讼、立案与受理、庭前准备与调解、开庭审理、判决与送达等步骤；费用方面主要包括诉讼费，可能涉及律师费、评估费等。以下是详细解答：

一、分居起诉离婚的流程

1. 准备诉讼材料

   • 基本材料：
     • 离婚起诉状：需明确原被告信息、诉讼请求（如离婚、子女抚养、财产分割等）及事实与理由（重点阐述分居的具体情况，包括分居时间、原因等）。
     • 身份证明：原告身份证、结婚证或婚姻关系证明。
     • 子女相关：子女出生证明、户口本（如涉及子女抚养问题）。
   • 分居证据：
     • 分居协议（如有）、租房合同、居委会或物业证明、双方关于分居的通信记录（如短信、微信聊天记录等），以证明双方确实处于分居状态且分居时间已满两年。
   • 财产证据：
     • 财产清单（包括房产、车辆、存款、股票等）及相关产权证明。
     • 双方经济状况证明（如收入证明、银行流水等），以便法院在判决财产分割时参考。

2. 确定管辖法院并提交诉讼

   • 管辖法院：一般由被告住所地法院管辖，若被告经常居住地与住所地不一致，则由经常居住地法院管辖。特殊情况下，如被告不在国内、下落不明、被采取强制性教育措施或被监禁等，可由原告住所地或经常居住地法院管辖。
   • 提交材料：将准备好的材料提交至有管辖权的法院立案庭，法院进行初步审查，符合立案条件的予以受理并通知缴纳诉讼费。

3. 立案与受理

   • 立案：法院在收到材料后7日内审查，符合起诉条件的立案，并向原告送达立案通知书。
   • 送达与答辩：法院立案后5日内向被告送达起诉状副本，被告应在15日内提出答辩状。

4. 庭前准备与调解

   • 证据交换：法院组织双方进行证据交换，明确争议焦点。
   • 调解：尝试通过调解解决纠纷，若调解成功则出具调解书，具有法律效力；若不成则进入庭审。

5. 开庭审理

   • 法庭调查：双方陈述诉求与答辩，举证质证。
   • 法庭辩论：围绕争议焦点展开辩论。
   • 最后陈述：双方表达最终意见。

6. 判决与送达

   • 判决：法院根据庭审情况、证据及法律规定作出判决，是否准予离婚及处理子女抚养、财产分割等问题。
   • 送达：判决书送达双方当事人，不服可在15日内提起上诉。

二、分居起诉离婚的费用

1. 诉讼费

   • 案件受理费：离婚案件每件交纳50元至300元，涉及财产分割的，财产总额不超过20万元的，不另行交纳；超过20万元的部分，按照0.5%交纳。计算公式为：诉讼费 = 50元至300元（基础费） + （财产总额 - 20万元） × 0.5%（超过部分费）。
   • 诉讼保全申请费（如有）：根据实际保全财产金额按比例交纳，具体费用标准可咨询法院。

2. 其他费用

   • 律师费：根据案件复杂程度和律师收费标准确定，不同律师、不同地区的收费标准可能有所不同。
   • 评估费（如需）：对财产进行评估时产生，如房产、车辆评估等，具体费用根据评估机构收费标准确定。

总结与建议：分居起诉离婚是一个涉及法律程序和费用的过程，需要准备充分的诉讼材料，明确管辖法院，并按照法院的程序进行。在整个过程中，应特别注意收集和保存分居证据，以证明双方确实处于分居状态且分居时间已满两年。同时，应了解相关费用，以便做好经济准备。如果你在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。