撤案后是否会有案底，主要取决于案件的性质、撤案的阶段以及撤案的具体原因。一般来说，若因没有犯罪事实或依法不追究刑事责任而撤案，则不会留下案底；但若已构成犯罪但因特定原因（如情节轻微）而撤案，或检察院作出酌定不起诉决定，则可能会留下相关记录。下面我将从不同情况为你详细分析：
一、不构成犯罪的撤案
侦查阶段撤案：
- 在侦查过程中，若公安机关或其他侦查机关发现不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任的，例如案件属于误会、所谓的“犯罪行为”实际并未发生，或犯罪嫌疑人的行为情节显著轻微、危害不大且不认为是犯罪，应当撤销案件。
- 此情况下，因未认定犯罪嫌疑人构成犯罪，故不会留下案底。
审查起诉阶段撤案：
- 检察机关在审查起诉时，若发现犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或存在《刑事诉讼法》第十六条规定的情形（如情节显著轻微、危害不大；犯罪已过追诉时效期限等），应作出不起诉决定。
- 对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或免除刑罚的，检察院也可作出不起诉决定。这两种不起诉决定均意味着犯罪嫌疑人不会被交付审判，因此不会有犯罪记录，即不会留下案底。
- 但需注意：若是检察院作出的酌定不起诉决定，其不起诉决定书会存入个人档案，可能视为一种特殊记录，尽管这不属于传统意义上的“案底”，但在某些特定情况下可能会被考虑。
二、构成犯罪但特殊情况撤案
- 在某些特定的自诉案件中，若被害人与被告人达成和解协议，被害人主动撤回起诉，且犯罪事实确实存在，只是基于被害人的意愿而撤案，严格来说行为人的行为依然构成犯罪。
- 但由于没有经过法院的有罪判决，从通常所理解的“案底”（即犯罪记录）角度，可能不会在官方的犯罪记录档案中留下记录。然而，司法机关处理案件过程中形成的相关材料可能会有留存。
三、存在特殊记录的情况
- 即使案件撤案没有犯罪记录，但在案件办理过程中，若发现有相关的行政违法行为并给予了行政处罚（如罚款、行政拘留等），则会留下行政处罚的记录。
- 这种记录虽不同于犯罪案底，但也属于一种不良记录，可能对个人的未来产生一定影响，例如在申请某些特定职业或进行背景调查时可能会被考虑。
四、相关法律依据
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条的规定，有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：
- 情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；
- 犯罪已过追诉时效期限的；
- 经特赦令免除刑罚的；
- 依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；
- 犯罪嫌疑人、被告人死亡的；
- 其他法律规定免予追究刑事责任的。
总结来说，撤案并不意味着完全没有记录。是否留下案底取决于多种因素，包括案件的性质、撤案的阶段以及撤案的具体原因。如果你或你身边的人遇到了类似的问题，或者对此有进一步的疑问，都可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供详细的法律解答。