针对小车超速50%被扣6分、罚款1000元的处理方式，核心结论如下：

1. 接受处罚并履行义务
   根据《道路交通安全法》第99条及《道路交通安全违法行为记分管理办法》，超速50%以上未达70%的，属于“严重超速”行为，公安机关交通管理部门将依法作出罚款1000元、记6分的处罚。您需在收到处罚决定书后15日内到指定银行缴纳罚款，逾期未缴将产生每日3%的滞纳金（最高不超过罚款本金），且可能影响车辆年检或驾驶证审验。

2. 对处罚有异议时的救济途径
   若您认为处罚存在事实认定错误（如测速设备故障、未标明限速标志）或程序违法（如未依法告知权利），可采取以下措施：

   • 申请行政复议：自收到处罚决定书之日起60日内向作出处罚的公安机关的上一级部门（如市公安局交通管理局）提出复议申请，需提交处罚决定书、身份证、行驶证及异议证据（如现场照片、测速设备校准记录）；
     
   • 提起行政诉讼：若复议结果仍不满意，可在收到复议决定书之日起15日内向法院起诉，法院将审查处罚的合法性（如是否超越职权、证据是否充分）。
     

3. 后续驾驶行为规范建议
   超速50%已构成“危险驾驶”的潜在风险，除接受处罚外，建议您：

   • 重新学习交通法规：通过“交管12123”APP完成安全教育课程，强化限速意识；
     
   • 检查车辆状态：确认测速设备记录的车速是否因车辆故障（如仪表盘误差）导致，必要时维修车辆；
     
   • 避免累积记分：本记分周期内若再被记6分，将面临驾驶证满分学习、考试，甚至吊销风险。
     

特别提醒：若处罚决定书载明“扣留驾驶证”，您需在处罚履行后凭缴款凭证到交管部门领回驾驶证；若涉及吊销驾驶证或更严重处罚（如超速70%以上），需进一步结合具体情节分析法律责任。如有疑问，可直接向我咨询细节。