扎车胎立案后，双方仍然可以协商调解。以下从不同角度为你详细分析：
法律程序角度
刑事立案后的调解可能性：
- 扎车胎行为若构成犯罪（如故意毁坏财物罪），在公安机关立案后，案件进入刑事诉讼程序。但刑事诉讼并不排除双方和解的可能性。
- 根据《刑事诉讼法》及相关司法解释，对于某些轻微刑事案件，如因民间纠纷引起的故意毁坏财物等，犯罪嫌疑人、被告人真诚悔罪，通过向被害人赔偿损失、赔礼道歉等方式获得被害人谅解，被害人自愿和解的，双方当事人可以和解。
- 因此，即使案件已经立案，双方仍有可能在司法机关的主持下进行调解，达成和解协议。
民事赔偿部分的调解：
- 无论扎车胎行为是否构成犯罪，被害人都有权要求犯罪嫌疑人或被告人赔偿因车胎被扎而遭受的损失。
- 在刑事诉讼过程中，被害人可以提起附带民事诉讼，要求赔偿。此时，双方可以在法院的主持下进行调解，就赔偿金额、赔偿方式等达成一致。
- 即使不提起附带民事诉讼，双方也可以在刑事诉讼之外自行协商赔偿事宜，达成和解。
实际操作角度
调解的主动性：
- 双方都可以主动提出调解的意愿。如果一方希望调解，可以向另一方表达，或者通过律师、司法机关等中间人传达调解的意愿。
- 司法机关在办理案件过程中，也会根据案件情况，适时向双方提出调解的建议，促进双方和解。
调解的灵活性：
- 调解不拘泥于法律程序，双方可以根据实际情况，灵活协商赔偿金额、赔偿方式、赔偿时间等。
- 调解协议的内容可以更加贴近双方的实际需求，有助于化解矛盾，促进和谐。
调解的效力：
- 一旦双方达成调解协议，并经过司法机关确认，调解协议就具有法律效力。双方应当履行调解协议约定的义务。
- 如果一方不履行调解协议，另一方可以向法院申请强制执行。
建议与注意事项
及时沟通：
- 如果双方希望调解，应当及时沟通，表达调解的意愿和诉求。避免因为拖延而错过调解的最佳时机。
保留证据：
- 在调解过程中，双方应当保留好相关证据，如车胎被扎的照片、维修发票、调解协议等。这些证据在后续履行调解协议或处理纠纷时可能起到关键作用。
寻求专业帮助：
- 如果双方对调解过程或调解协议的内容有疑问或不确定，可以寻求律师等专业人士的帮助。他们可以提供专业的法律意见和建议，确保调解的合法性和有效性。
总结来说，扎车胎立案后，双方仍然可以协商调解。无论是从法律程序角度还是实际操作角度，调解都是一种可行且有效的解决纠纷的方式。如果你或他人遇到类似情况，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见和建议。