取保候审期限已过16年，案件通常已超过法定追诉时效或已被依法处理，需分情况讨论处理方式：

1. 若案件已过追诉时效
   根据《刑法》第八十七条，法定最高刑为不满五年有期徒刑的，追诉时效为五年；最高刑为五年以上不满十年有期徒刑的，追诉时效为十年；最高刑为十年以上有期徒刑的，追诉时效为十五年；最高刑为无期徒刑、死刑的，追诉时效为二十年。

   • 若原犯罪行为对应的法定最高刑低于十年有期徒刑（如普通盗窃、诈骗等），则16年已远超追诉时效，司法机关通常不再追究刑事责任。
     
   • 若原犯罪行为对应的法定最高刑为十年以上有期徒刑（如故意伤害致人重伤、抢劫等），需进一步判断是否已超过二十年追诉时效。若未超过，但司法机关未立案或未采取强制措施，仍可能被追诉；若已超过，则不再追究。

2. 若案件未过追诉时效，但取保候审期限已届满
   取保候审最长不超过十二个月（《刑事诉讼法》第七十九条），期限届满后，司法机关应解除强制措施并撤销案件，或依法变更强制措施（如逮捕）。

   • 若16年前取保候审期限届满后，司法机关未采取进一步措施（如移送审查起诉、提起公诉），且未说明理由，可能涉及程序违法。此时可向原办案机关申请撤销案件或要求说明情况，必要时可向检察机关申请立案监督。
     
   • 若案件已进入审判阶段但未宣判，取保候审期限届满不影响诉讼程序继续进行，但需关注案件是否已被依法处理（如判决、撤诉等）。

3. 若案件已被依法处理（如判决、撤诉等）

   • 若16年前案件已通过判决、裁定或撤诉等方式结案，则取保候审程序已终结，无需额外处理。但若对处理结果有异议（如认为判决不公），可依法申请再审或申诉，但需注意申诉时效（通常为判决生效后两年内，特殊情况可延长）。

建议行动步骤：

1. 查询案件状态：联系原办案机关（如公安局、检察院、法院）或通过中国裁判文书网查询案件是否已结案、处理结果如何。
   
2. 申请信息公开：若无法获取案件信息，可向原办案机关申请政府信息公开，要求提供案件处理情况说明。
   
3. 咨询专业意见：若案件涉及复杂法律问题（如追诉时效计算、程序违法认定等），建议携带相关材料（如取保候审决定书、案件编号等）进一步咨询，以便精准分析。
   

总结：取保候审16年后，案件可能因追诉时效届满或程序终结而不再处理，但需通过查询案件状态确认。若发现程序违法或处理不当，可依法主张权利。