您好，针对您因两次闯红灯被扣12分的情况，我将为您详细解答如何处理这一问题，以确保您的驾驶证能够恢复正常使用。
一、确认违章信息并缴纳罚款
首先，您需要通过交通管理部门的官方网站、手机APP（如交管12123）或前往当地交警大队的违法处理窗口，查询闯红灯的具体违章记录。请仔细核对违章时间、地点及照片等信息，确保无误。确认违章后，您需要携带驾驶证、车辆行驶证和身份证，前往指定地点或通过线上渠道处理违章记录，并按规定缴纳罚款。请注意，逾期未缴纳罚款将产生滞纳金。
二、驾驶证扣留与参加学习
根据我国相关法律规定，闯两次红灯累计扣12分后，您的驾驶证将被公安机关交通管理部门扣留。在缴纳罚款后的15日内，您需要到机动车驾驶证核发地或违法行为地的公安机关交通管理部门报名参加为期七日的道路交通安全法律、法规和相关知识学习。学习内容涵盖道路交通安全法律、法规、规章，交通信号含义，安全行车与文明驾驶知识等。每日学习时间不少于8个学时，请确保按时参加并认真学习。
三、预约并参加考试
学习结束后，车辆管理所将在20日内安排道路交通安全法律、法规和相关知识考试（即科目一考试）。您需要提前预约考试时间，并按时参加考试。考试合格后，您的记分将被清除，并发还机动车驾驶证。若考试不合格，您需要重新预约并参加考试，直至合格为止。
四、特殊情况处理
误闯红灯复议：如果您因视线被遮挡等特殊情况误闯红灯，可以在收到违法信息后向车辆管理处申请复议，并提供相关证据。若复议成功，红灯记录将被取消，不扣分也不罚款。
B类、A类驾照降级：如果您持有大型客车（A1）、牵引车（A2）、城市公交车（A3）、中型客车（B1）、大型货车（B2）驾驶证，在一个记分周期内记满12分，车辆管理所将注销您的最高准驾车型驾驶资格，并通知您在三十日内办理降级换证业务。降级后，您需要按规定参加审验学习。
五、重要注意事项
不可代扣：请严禁使用他人驾驶证代扣分数，此行为属于“买卖分”，是违法的，将受到严厉处罚。
遵守交规：在处理完违章并恢复驾驶资格后，请务必严格遵守交通规则，避免再次发生违法行为，确保行车安全。
及时处理：建议您尽快查询并处理违章记录，以避免因拖延而导致更多不必要的麻烦和损失。
综上所述，因两次闯红灯被扣12分后，您需要按流程缴纳罚款、参加学习与考试，并注意特殊情况和相关法律规定。希望这些信息能够帮助您顺利解决问题，并增强您的交通安全意识。如有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询。