如果发现自己的身份或店铺被别人用来办理了营业执照，这确实是一个严重的问题，它侵犯了你的合法权益。为了有效应对并妥善解决这一问题，你可以按照以下步骤来操作：
一、确认信息并收集证据
核实信息：
- 如果你发现的是店铺被冒用，首先通过官方渠道（如国家企业信用信息公示系统）查询该营业执照的详细信息，确认其真实性与合法性。
- 如果你发现的是身份被冒用，同样通过官方渠道查询是否有以你名义注册的营业执照。
收集证据：
- 店铺相关：如果是店铺被冒用，收集房屋租赁合同、房产证等证明你对店铺拥有合法使用权的文件。
- 身份相关：如果是身份被冒用，整理身份证、户口本等官方证件，以及能证明你对注册营业执照一事并不知情的证据，如出行记录、监控视频、笔迹鉴定等。
- 营业执照相关：获取被冒用注册的营业执照副本照片、工商登记档案资料等关键信息。
二、尝试与侵权人沟通
联系侵权人：
- 在掌握充分证据后，尝试通过多种渠道联系侵权人，要求其尽快前往市场监督管理部门办理营业执照地址变更或注销手续（针对店铺被冒用）。
- 如果是身份被冒用，则要求侵权人停止侵权行为，并配合你进行后续的撤销登记等操作。
保留沟通记录：
- 在沟通过程中，务必保持冷静和理智，避免冲突，并保留好相关的聊天记录、通话录音等作为后续可能的证据。
三、向市场监督管理部门反映情况
提交书面申请：
- 携带个人有效身份证件及上述收集的证据，前往营业执照登记机关提交撤销冒用身份登记或变更/注销营业执照的书面申请。
- 申请书中应详细阐述被冒用身份或店铺注册的具体情况，包括发现时间、可能的原因及影响等。
配合调查：
- 市场监管部门在收到申请后，会展开调查。在此期间，应积极配合调查工作，提供所需补充材料，并对相关情况进行如实说明。
四、考虑报警处理
- 报警：
- 鉴于冒用他人身份或店铺注册营业执照属于违法行为，应向当地公安机关报案。
- 报案时，提供尽可能详尽的信息和证据，以便警方迅速开展调查，并采取相应措施。
五、法律途径维护权益
行政复议或行政诉讼：
- 若对市场监管部门的处理结果不满，可在知道具体行政行为之日起六十日内提出行政复议申请。
- 若对行政复议结果仍不服，或市场监管部门在规定期限内未作出处理决定，可在收到复议决定书之日起十五日内向人民法院提起行政诉讼。
民事诉讼：
- 根据《中华人民共和国民法典》，你有权要求冒用者停止侵害、消除影响，并赔偿因此造成的损失。
- 可通过协商或向人民法院提起民事诉讼来主张权利。
追究刑事责任：
- 若冒用者的行为涉嫌犯罪，如构成诈骗罪、虚假注册罪等，应向公安机关报案，由司法机关依法追究其刑事责任。
六、防范类似事件再次发生
加强个人信息保护：
- 不随意泄露个人身份信息，特别是在网络上要谨慎行事。
- 定期检查自己的信用记录和工商注册信息，及时发现并处理问题。
提高警惕性：
- 对于任何要求提供个人身份信息或店铺信息的请求，都要保持高度警惕，确认对方身份和请求的合法性后再进行提供。
在整个处理过程中，保持冷静与理智是至关重要的。通过合法途径解决问题不仅能更好地保护自己的权益，也能避免不必要的麻烦和损失。希望这些建议能对你有所帮助，如果你还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。