结论：司法调解后三年是否还能起诉，需根据调解协议的性质及是否履行、是否具有强制执行效力等因素综合判断。以下分情况详细说明：
1. 调解协议具有民事合同性质，未履行或未完全履行
- 法律背景：根据《中华人民共和国人民调解法》第三十一条，经人民调解委员会调解达成的调解协议，具有法律约束力，当事人应当按照约定履行。若一方未履行，另一方可依据《民事诉讼法》相关规定，向法院提起诉讼，要求对方履行调解协议或承担违约责任。
- 时间限制：诉讼时效一般为三年，自权利人知道或应当知道权利受到损害之日起计算。若调解后三年内未履行，且未超过诉讼时效，仍可起诉。
- 示例：甲与乙因邻里纠纷达成调解协议，约定乙赔偿甲5000元，但乙未履行。三年内甲可起诉乙要求履行赔偿义务。
2. 调解协议经司法确认，具有强制执行效力
- 法律背景：根据《人民调解法》第三十三条，经人民调解委员会调解达成调解协议后，双方当事人认为有必要的，可以自调解协议生效之日起三十日内共同向人民法院申请司法确认。经确认的调解协议，一方拒绝履行的，另一方可向法院申请强制执行，无需另行起诉。
- 时间限制：申请强制执行的期限为二年，自调解协议规定的履行期间最后一日起计算。若已申请司法确认，三年内仍可申请强制执行（若未超过二年期限）。
- 示例：甲与乙达成调解协议后申请司法确认，法院裁定确认有效。乙未履行，甲可在二年内申请强制执行，无需起诉。
3. 调解协议涉及刑事案件附带民事赔偿
- 法律背景：若调解协议系刑事案件中附带民事赔偿部分，且未履行，被害人可在刑事诉讼过程中或结束后，就民事赔偿部分单独提起民事诉讼。诉讼时效同样为三年。
- 示例：甲因乙的犯罪行为受伤，双方在刑事诉讼中达成赔偿调解协议，但乙未履行。甲可在三年内提起民事诉讼要求赔偿。
4. 调解协议存在无效或可撤销情形
- 法律背景：若调解协议存在欺诈、胁迫、显失公平等情形，当事人可依据《民法典》相关规定，请求法院或仲裁机构撤销或确认无效。撤销或确认无效后，可就原纠纷重新起诉。
- 时间限制：撤销权行使期限为一年，自知道或应当知道撤销事由之日起计算；确认无效无时间限制，但需在诉讼时效内主张权利。
- 示例：甲被乙胁迫签订调解协议，甲在一年内可起诉要求撤销协议，并就原纠纷重新主张权利。
法律建议
- 核实调解协议性质：首先确认调解协议是否经司法确认、是否涉及刑事案件、是否存在无效或可撤销情形。
- 检查履行情况：若对方未履行，检查是否超过诉讼时效或申请强制执行期限。
- 收集证据：保留调解协议、履行情况证明、沟通记录等证据，以备诉讼或申请执行。
- 及时行动：若符合起诉条件，建议尽快向法院提起诉讼或申请强制执行，避免超过期限。
总结：司法调解后三年能否起诉，需结合调解协议性质、履行情况、是否经司法确认等因素综合判断。若符合起诉条件，仍可依法主张权利。如有具体案件或疑问，可直接向我咨询，我将根据案情提供详细法律分析。