一份合同中包含两个税率时，需根据具体交易性质、合同条款及法律规定，区分不同业务适用对应税率，并在合同中明确约定计税方式，避免税务风险。 以下是具体分析：

1. 区分交易性质，分别适用税率
   若合同涉及多项独立业务（如销售货物+提供服务），需根据《增值税暂行条例》等规定，对不同业务按各自税率计税。例如：

   • 销售设备（税率13%）+ 安装服务（税率9%），应分别核算收入并适用对应税率；
     
   • 若未分别核算，税务机关可能按高税率或从高适用税率征税（《增值税暂行条例》第三条）。
     建议：在合同中拆分业务条款，明确各部分交易内容、金额及税率，并附上税务分类编码（如“销售货物”“建筑服务”）。

2. 合同条款明确计税方式
   若同一业务因政策调整或混合销售导致税率变化（如不动产租赁税率下调），需在合同中约定：

   • 税率调整条款：如“本合同执行期间，若国家调整税率，自调整之日起，按新税率执行”；
     
   • 价税分离条款：明确不含税价、税率及税额，避免因税率变化引发争议。
     示例：合同总价100万元，可约定“其中不含税价90.09万元，税率10%，税额9.91万元；若税率调整为9%，则不含税价调整为91.74万元，税额8.26万元”。

3. 混合销售与兼营的税务处理

   • 混合销售：一项销售行为既涉及货物又涉及服务（如销售设备并安装），若主业为销售货物，按货物税率计税；若主业为服务，按服务税率计税（《增值税暂行条例实施细则》第五条）；
     
   • 兼营：纳税人兼营不同税率项目，应分别核算收入，未分别核算的从高适用税率（《增值税暂行条例》第三条）。
     关键点：需通过合同条款、业务实质证明交易性质，避免被税务机关认定为“未分别核算”。

4. 税务合规与风险防范

   • 发票开具：按合同约定税率分别开具发票，避免“一张发票混用税率”；
     
   • 备案与说明：若涉及特殊业务（如跨境服务免税），需在合同中注明政策依据，并留存备案资料；
     
   • 争议解决：在合同中约定税务争议解决方式（如协商、仲裁或诉讼），降低纠纷成本。

总结：合同中涉及多个税率时，核心是“区分业务性质+明确计税规则”。建议结合具体交易模式，在合同中细化条款，并咨询税务机关或专业律师（即我本人）审核，确保合规性。若有进一步疑问，可直接向我提供合同背景，我会为您定制解决方案。