安全部门本身一般没有直接权利扣员工绩效，但需视具体情况和公司规章制度而定。以下从不同角度为你详细分析：

从法律原则角度

从法律的基本原则来看，员工的绩效工资属于其劳动报酬的一部分。根据《中华人民共和国劳动法》以及《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。绩效工资的发放通常与员工的工作表现、工作成果等挂钩，而安全部门的主要职责是保障公司的安全生产、防范安全风险等，其工作性质并不直接涉及对员工工作绩效的考核与评定。所以，在一般情况下，安全部门没有直接扣除员工绩效工资的法定权利。

从公司规章制度角度

然而，在实际工作中，很多公司会制定详细的内部规章制度，对员工的绩效评估、工资发放等方面进行规定。如果公司的规章制度中明确赋予了安全部门在某些特定情况下（如员工违反安全规定、造成安全事故等）有权扣除一定比例的绩效工资，并且该规章制度经过了合法的制定程序（如经过职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定等），向员工进行了公示或者告知，那么在这种情况下，安全部门可能依据公司规章制度扣除员工绩效工资。但即便如此，扣除的金额和方式也应当合理，不能违反法律法规的强制性规定。例如，不能因为员工一次轻微的安全违规行为就扣除其全部绩效工资，这种做法可能被认定为不合理，员工有权提出异议。

从实际操作角度

如果安全部门认为员工存在需要扣除绩效工资的情况，应当按照公司规定的程序进行操作。一般来说，需要先收集相关证据，证明员工确实存在违反安全规定等行为，然后将情况报告给具有绩效评估和工资发放决策权的部门（如人力资源部门），由这些部门根据公司的规章制度和实际情况来决定是否扣除以及扣除的金额。安全部门不能自行直接扣除员工绩效工资，否则可能构成违法行为，员工可以依法维护自己的合法权益。

给员工的建议

如果你遇到安全部门要扣除你绩效工资的情况，你可以先查看公司的规章制度，了解相关规定和程序。如果你认为安全部门的做法不符合规定或者不合理，你可以与公司的人力资源部门或者上级领导进行沟通协商，表达你的意见和诉求。如果沟通协商无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉，或者依法申请劳动仲裁，通过法律途径来维护自己的合法权益。

希望以上解答能对你有所帮助，如果你还有其他关于劳动工伤（工资福利）方面的问题，欢迎直接向我咨询。