三轮车超载两人，一般会面临行政处罚，具体处理方式需结合实际情况判断，以下是详细分析：

1. 行政处罚的法律依据与种类
   根据《道路交通安全法》第九十二条，货运机动车超过核定载质量的，处二百元以上五百元以下罚款；超过核定载质量百分之三十或者违反规定载客的，处五百元以上二千元以下罚款，并可能被扣留机动车至违法状态消除。三轮车若被认定为货运机动车，超载两人属于“违反规定载客”，将面临上述罚款及扣车风险。若三轮车被认定为非机动车（如电动三轮车未达到机动车标准），则依据《道路交通安全法》第八十九条，可能被处警告或五元以上五十元以下罚款；非机动车驾驶人拒绝接受处罚的，可能被扣留非机动车。

2. 处罚的裁量因素

• 车辆类型：三轮车是否属于机动车是关键。若车辆设计时速、空车质量、外形尺寸符合机动车标准，或已列入工信部《道路机动车辆生产企业及产品公告》，则按机动车处罚；否则按非机动车处理。
  
• 超载比例：部分地区会结合超载人数占核定载客数的比例（如超载50%以上）加重处罚，但三轮车通常无明确核定载客数，实践中多以“是否载人”为判断标准。
  
• 地方性法规：如《XX省道路交通安全条例》可能对三轮车超载设定更具体的罚款幅度（如“超载一人罚款50元”），需结合当地规定。

1. 其他潜在后果
   

• 事故责任：若超载导致交通事故，超载行为可能被认定为过错，加重驾驶人赔偿责任。
  
• 车辆扣留：根据《道路交通安全法》第九十二条，超载严重的三轮车可能被扣留至违法状态消除（如卸载超载人员）。
  
• 强制教育：部分地区对非机动车违法驾驶人实施现场安全教育或体验式执法（如协助维持交通秩序）。

建议：若您或他人因三轮车超载被处罚，可先确认车辆性质（机动车/非机动车）及当地具体规定。若对处罚有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。如有进一步疑问，欢迎直接向我咨询具体场景下的法律应对方案。