申请强制执行对被告公司确实存在多方面的不利因素，这些不利因素主要体现在以下几个方面：
财产被查封、冻结或划拨：
- 一旦法院裁定强制执行，被告公司的银行账户、房产、车辆等财产可能会被查封、冻结，甚至直接划拨给申请执行人以偿还债务。这将直接影响公司的正常运营和资金流动，可能导致公司无法按时支付员工工资、供应商货款等，进而引发一系列连锁反应。
信用受损：
- 强制执行记录会被纳入公司的信用档案，对公司的信用评级产生负面影响。这可能导致公司在未来的融资、招投标、合作等方面受到限制，增加公司的运营成本和风险。
限制高消费及非生活或经营必需的消费：
- 根据相关法律规定，被执行人（包括公司及其法定代表人、主要负责人等）可能被限制高消费及非生活或经营必需的消费，如乘坐飞机、高铁等交通工具，入住高档酒店，购买不动产或非经营必需车辆等。这将影响公司相关人员的出行和生活品质，也可能对公司的商务活动产生不利影响。
可能面临司法拘留或刑事责任：
- 如果被告公司有能力履行而拒不履行法院生效判决、裁定，情节严重的，公司及其直接负责的主管人员和其他直接责任人员可能面临司法拘留的处罚。此外，如果构成拒不执行判决、裁定罪，还可能被追究刑事责任，这将对公司及其相关人员产生极其严重的法律后果。
影响公司声誉和形象：
- 强制执行过程往往公开透明，相关信息可能被媒体报道或在社会上传播，从而对公司的声誉和形象造成负面影响。这可能导致客户流失、合作伙伴减少等不利后果，进一步加剧公司的经营困境。
针对以上不利因素，我建议被告公司采取以下措施来应对：
- 积极与申请执行人协商：在强制执行程序启动前或进行中，被告公司可以积极与申请执行人协商，寻求和解或分期履行等方案，以减轻强制执行带来的不利影响。
- 及时履行生效法律文书确定的义务：如果公司确实有能力履行生效法律文书确定的义务，应当及时履行，以避免被强制执行和承担更严重的法律后果。
- 寻求法律援助：如果公司对强制执行程序或相关法律规定不了解，可以寻求专业律师的法律援助，以便更好地维护自身合法权益。
最后，需要强调的是，强制执行是法律赋予申请执行人的一种重要救济手段，被告公司应当尊重法律判决和裁定，积极履行义务，以维护自身的合法权益和社会的公平正义。如果您在强制执行过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。