逾期交房两年多，起诉后续违约金的计算方式需根据购房合同中的具体约定以及相关法律规定来确定，以下分情况说明：

1. 合同有明确约定违约金计算方式

   • 如果购房合同中明确规定了逾期交房违约金的计算方法，比如按照已付房款的日万分之几来计算，那么在起诉时，法院一般会按照合同约定来判决开发商支付违约金。例如，合同约定逾期交房违约金按已付房款的日万分之一计算，您已付房款100万元，逾期两年（按730天算），那么违约金就是100万×0.01%×730 = 73000元。
   • 不过，如果开发商认为合同约定的违约金过高，请求法院予以减少，法院可能会根据实际情况，比如房屋所在地段的租金水平、您的实际损失等因素，对违约金进行调整。反之，如果您认为合同约定的违约金过低，不足以弥补您的损失，也可以请求法院增加，但您需要提供相应的证据证明您的实际损失高于合同约定的违约金数额。

2. 合同未明确约定违约金计算方式

   • 当购房合同中没有明确约定逾期交房违约金的计算方法时，根据《最高人民法院关于审理商品房买卖合同纠纷案件适用法律若干问题的解释》的规定，逾期交付使用房屋的，按照逾期交付使用房屋期间有关主管部门公布或者有资格的房地产评估机构评定的同地段同类房屋租金标准确定。也就是说，您可以向法院申请委托有资格的房地产评估机构对同地段同类房屋的租金进行评估，以该租金标准作为计算违约金的依据。比如，评估机构评估出同地段同类房屋月租金为3000元，逾期两年（24个月），那么开发商应支付的违约金大致为3000×24 = 72000元。

另外，在起诉开发商要求支付逾期交房违约金时，还需要注意以下几点：

• 诉讼时效：向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。在逾期交房的情况下，诉讼时效一般从合同约定的交房日期届满之次日起算。所以，您要及时主张自己的权利，避免因超过诉讼时效而丧失胜诉权。
• 证据收集：要收集好能够证明开发商逾期交房以及您已履行付款义务等相关证据，比如购房合同、付款凭证、开发商的交房通知（如果有）、与开发商沟通逾期交房问题的记录等，这些证据对于支持您的诉讼请求至关重要。

如果您在处理逾期交房违约金问题过程中还有其他疑问，欢迎随时向我咨询。