结论：公司员工通过抬高转让费获取好处，是否构成非国家工作人员受贿罪，需结合具体情形判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、构成非国家工作人员受贿罪的情形
主体要件：
- 员工需为公司、企业或其他单位的工作人员，即非国家工作人员。若员工具有国家工作人员身份（如国有企业中从事公务的人员），则可能构成受贿罪，而非非国家工作人员受贿罪。
行为要件：
- 员工利用职务上的便利，通过抬高转让费的方式，为他人谋取利益。这里的“职务上的便利”指的是员工在其职权范围内，能够影响或决定转让费的高低，从而为他人提供不正当的利益。
- 员工收受或索取他人财物，作为抬高转让费的回报。这里的“财物”包括货币、实物以及可以用货币估价并可以转让的其他财产性利益。
主观要件：
- 员工具有故意的主观心态，即明知自己的行为会损害公司利益，仍为了个人私利而实施。
法律依据：
- 根据《中华人民共和国刑法》第一百六十三条：“公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，索取他人财物或者非法收受他人财物，为他人谋取利益，数额较大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金。”
二、不构成非国家工作人员受贿罪的情形
缺乏职务便利：
- 如果员工并未利用其职务上的便利来抬高转让费，而是基于市场行情、谈判技巧或其他非职务因素，那么其行为可能不构成犯罪。
未收受或索取财物：
- 如果员工虽然抬高了转让费，但并未从中收受或索取任何财物，或者收受的财物与抬高转让费的行为无直接关联，那么其行为也不构成犯罪。
数额未达标准：
- 根据相关司法解释，非国家工作人员受贿罪的成立需要达到一定的数额标准。如果员工收受的财物数额较小，未达到刑事立案标准，那么其行为可能只构成一般违法行为，而不构成犯罪。
三、其他注意事项
证据收集：
- 在判断员工是否构成非国家工作人员受贿罪时，证据的收集至关重要。需要收集员工利用职务便利、抬高转让费、收受或索取财物以及为他人谋取利益等方面的证据。
法律程序：
- 如果怀疑员工构成非国家工作人员受贿罪，应当及时向公安机关报案，并配合公安机关的调查工作。在法律程序中，需要遵循法定程序，保障员工的合法权益。
合规建议：
- 公司应建立健全内部管理制度，加强对员工行为的监督和管理，防止员工利用职务便利谋取私利。同时，公司应加强对员工的法律培训，提高员工的法律意识和合规意识。
总结：公司员工通过抬高转让费获取好处是否构成非国家工作人员受贿罪，需根据具体情形判断。如果员工利用职务便利、收受或索取财物并为他人谋取利益，且数额达到刑事立案标准，则可能构成犯罪。如有具体法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。