结论：非法经营没有公诉但有案底，可能是因为案件在侦查阶段或审查起诉阶段被撤销、终止，但相关记录仍被保留；或者案件被转为行政处罚，但行政处罚记录也被视为案底的一种。以下是对此问题的详细分析：

1. 案件处理阶段与案底保留：

   • 在刑事案件中，即使案件最终没有进入公诉阶段，也可能在侦查阶段或审查起诉阶段因各种原因（如证据不足、情节轻微等）被撤销或终止。然而，这些阶段的记录，包括立案、侦查、审查起诉等，都可能被保留在公安机关或检察机关的档案中，形成所谓的“案底”。
   • 案底通常指的是个人因违法犯罪行为而留下的记录，这些记录可能包括刑事案件的立案、侦查、起诉、审判等各个环节的信息，即使案件最终没有定罪，相关记录也可能被保留。

2. 行政处罚与案底：

   • 对于非法经营行为，如果情节较轻，可能不会被追究刑事责任，而是被处以行政处罚，如罚款、没收违法所得、责令停业整顿等。
   • 行政处罚记录虽然不属于刑事案底，但在某些情况下（如求职、出国等），也可能被视为不良记录，对个人产生一定影响。此外，如果行政处罚记录被录入相关系统，也可能在某种程度上被视为一种“案底”。

3. 案底的影响与消除：

   • 案底的存在可能对个人产生多方面的影响，包括但不限于就业、出国、贷款等。因此，了解案底的情况并采取相应的措施是非常重要的。
   • 如果认为案底记录有误或应当消除，可以向相关部门（如公安机关、检察机关等）提出申请，要求更正或消除记录。但需要注意的是，案底的消除并非易事，需要符合一定的条件和程序。

4. 法律建议：

   • 如果你或你认识的人面临非法经营的问题，并且担心可能留下案底，建议尽快咨询专业律师，了解案件的具体情况和可能的法律后果。
   • 律师可以根据案件的具体情况，为你提供专业的法律建议，包括如何应对侦查、审查起诉等阶段的调查，以及如何处理可能留下的案底记录。

进一步思考：案底的存在对个人生活的影响不容忽视。因此，在日常生活中，我们应该遵守法律法规，避免违法犯罪行为的发生。同时，如果确实面临法律问题，也应该及时寻求专业律师的帮助，以维护自己的合法权益。如果你有任何关于刑事案件或律师会见的问题，都可以直接向我咨询。