结论前置：

1. 一般情况下，合作协议书合同签字没有按手印，并不影响合同的生效。
2. 但如果合同中明确约定了需同时签字并按手印才生效，那么未按手印将影响合同的生效。

详细分析：

一、签字、盖章与按手印的同等法律效力

根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条的规定，当事人采用合同书形式订立合同时，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这一法条明确了签字、盖章和按手印在合同成立上具有同等的法律效力。这意味着，在合同签署过程中，无论选择签字、盖章还是按手印，都是当事人确认合同内容并表示同意的有效方式。因此，仅签字而未按手印，并不影响合同的成立和生效。

二、合同生效的其他必要条件

合同成立并不等同于合同生效。除了签字、盖章或按手印外，合同生效还需满足其他条件，如行为人具有相应的民事行为能力、意思表示真实、不违反法律或行政法规的强制性规定，以及不违背公序良俗等。例如，一个不具备完全民事行为能力的个体所签订的合同，即使其签字了，也可能因不符合行为能力要求而被认定为无效。因此，在判断合同是否生效时，需要综合考虑多个因素。

三、特殊约定的影响

如果合同双方在签订时明确约定了“本合同自双方签字且按手印之日起生效”，那么此时仅签字而未按手印将不足以使合同生效。因为在此情况下，按手印成为了合同生效的必要条件之一。附生效条件的合同，自条件成就时方为生效。因此，在签订合同时，双方应仔细阅读合同条款，确保对合同的生效条件有清晰的理解。

四、实际操作中的注意事项

1. 合同内容的合法性：无论合同是否按手印，其内容都必须合法。合同必须是双方真实的意思表示，且不得违反法律法规的强制性规定或损害他人的合法权益。只有满足这些条件的合同，才能被视为有效合同。

2. 证据保留：在合同签署过程中，建议保留好相关的证据，如签字或盖章的原件、合同文本等。这些证据在后续可能发生的纠纷中，将起到重要的证明作用。

3. 争议解决：如果因合同生效问题发生争议，双方应首先尝试通过协商解决。如果协商无果，可以考虑通过诉讼或仲裁等法律途径解决争议。

总结与建议：

合作协议书合同签字没有按手印，在一般情况下并不会影响合同的生效。但如合同中明确约定需同时签字并按手印才生效，则未按手印将影响合同生效。因此，在签订合同时，双方应仔细阅读合同条款，确保对合同的生效条件有清晰的理解，并保留好相关的证据。如果遇到任何疑问或纠纷，可以直接向我咨询，我将根据具体情况为你提供专业的法律意见和帮助。