公司与控股子公司之间在正常情况下不会因股权关系直接产生土地权属争议，但若存在土地权属登记瑕疵、实际使用与登记不符、合同约定不明或内部管理混乱等特殊情况，则可能引发争议。以下是对此问题的详细分析：

一、正常情况下的股权关系与土地权属

1. 股权关系：控股子公司是指其股权被另一公司（即母公司）所控制的公司。母公司通过持有子公司的多数股权，从而对子公司的经营决策产生重大影响。然而，股权关系本身并不直接涉及土地权属问题。

2. 土地权属：土地权属是指土地的所有权、使用权等权利归属。在我国，土地权属的确认和变更需遵循相关法律法规，并办理相应的登记手续。土地权属的争议通常涉及土地的所有权、使用权、他项权利等。

二、可能引发土地权属争议的特殊情况

1. 土地权属登记瑕疵：

   • 如果子公司名下的土地权属登记存在瑕疵，如登记错误、未及时办理变更登记等，可能导致母公司与子公司之间或子公司与第三方之间就土地权属产生争议。

2. 实际使用与登记不符：

   • 在某些情况下，子公司可能实际使用某块土地，但该土地并未登记在子公司名下，而是登记在母公司或其他关联公司名下。这种实际使用与登记不符的情况可能引发土地权属争议。

3. 合同约定不明：

   • 如果母公司与子公司之间就土地的使用、转让等事项存在合同约定，但合同条款不明确或存在歧义，可能导致双方在履行合同过程中就土地权属产生争议。

4. 内部管理混乱：

   • 如果母公司与子公司之间的内部管理混乱，如土地权属文件丢失、未经批准擅自转让土地等，也可能引发土地权属争议。

三、法律建议与预防措施

1. 完善土地权属登记：

   • 母公司和子公司应确保各自名下的土地权属登记准确无误，并及时办理变更登记手续，以避免因登记瑕疵引发争议。

2. 明确合同条款：

   • 在母公司与子公司之间就土地的使用、转让等事项签订合同时，应明确合同条款，避免歧义和模糊表述，以确保双方权益得到保障。

3. 加强内部管理：

   • 母公司和子公司应建立健全内部管理制度，加强对土地权属文件的管理和保管，防止文件丢失或未经批准擅自转让土地等情况的发生。

4. 及时解决争议：

   • 如果发生土地权属争议，母公司和子公司应及时通过协商、调解或诉讼等方式解决争议，以避免争议扩大化并影响双方的正常经营。

总结来说，虽然公司与控股子公司之间在正常情况下不会因股权关系直接产生土地权属争议，但仍需注意上述可能引发争议的特殊情况，并采取相应的预防措施以避免争议的发生。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。