协商解除劳动合同的经济补偿金计算方式主要依据《劳动合同法》第四十七条，具体分为以下两种情况：

1. 双方协商一致解除且由用人单位提出
   经济补偿金按劳动者在本单位工作的年限计算，每满1年支付1个月工资的标准向劳动者支付。6个月以上不满1年的，按1年计算；不满6个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
   例如：工作3年6个月，补偿金为4个月工资；工作2年3个月，补偿金为2.5个月工资。

2. 劳动者主动提出解除并协商一致
   若解除协议由劳动者主动提出，用人单位无需支付经济补偿金，但双方可自行约定补偿（法律不禁止但非强制）。

关键细节补充：

• 月工资标准：指劳动者在劳动合同解除前12个月的平均工资（含基本工资、奖金、津贴等货币性收入），若高于当地上年度职工月平均工资3倍的，按3倍封顶计算，且补偿年限最高不超过12年（仅限高收入群体）。
  
• 特殊情形：若用人单位存在未及时足额支付劳动报酬、未依法缴纳社保等违法行为，劳动者依据《劳动合同法》第三十八条提出解除的，虽形式上可能表现为“协商”，但实质属于被迫解除，此时经济补偿金计算方式与上述第1种情况相同。

建议操作：

1. 签订书面解除协议时，明确补偿金额及支付时间；
   
2. 保留工资发放记录、工作年限证据（如劳动合同、社保记录）；
   
3. 若对补偿金额有争议，可申请劳动仲裁，仲裁时效为解除之日起1年内。
   

如有具体案例细节（如工资结构、解除原因等），可进一步向我说明，我会帮您细化分析。