政府部门劳务派遣工和合同工在多个方面存在显著差异，以下是对这些差异的详细分析：
法律关系与合同签订：
- 劳务派遣工：与劳务派遣单位签订劳动合同，形成劳动关系，但实际工作在政府部门（用工单位），与政府部门之间形成的是劳务关系。劳务派遣单位负责招聘、管理劳动者，并根据政府部门的需求派遣劳动者工作。
- 合同工：直接与政府部门签订劳动合同，形成直接的劳动关系，接受政府部门的直接管理和工作安排。
招聘方式与人事管理：
- 劳务派遣工：由劳务派遣单位负责招聘，通过多渠道招募人员，并根据政府部门需求筛选合适人选进行派遣。人事管理归第三方劳务公司负责，政府部门不直接参与。
- 合同工：由政府部门自行组织招聘，通过发布招聘信息、面试、笔试等流程直接招聘劳动者。人事管理由政府部门直接负责，包括员工的培训、考核、晋升等。
薪酬福利与社会保险：
- 劳务派遣工：工资、福利等待遇一般由劳务派遣单位发放和管理，可能相对低于政府部门的正式合同工。社会保险费由劳务派遣单位负责缴纳，但在实际操作中，可能存在社保缴纳基数、公积金比例等较低的情况。
- 合同工：工资、奖金、福利等均由政府部门直接发放和管理，享受完整的福利待遇体系，包括法定福利（如五险一金）及单位自主设定的福利项目，如年终奖金、节日福利、带薪年假等。
职业稳定性与灵活性：
- 劳务派遣工：职业稳定性相对较低，政府部门可根据业务需求变化退回劳动者给劳务派遣单位。劳务派遣单位可能会重新安排劳动者到其他用工单位，若未能及时安排，劳动者可能面临待岗甚至失业风险。适用于临时性、辅助性或替代性岗位。
- 合同工：职业稳定性相对较高，只要劳动者遵守规章制度、胜任工作岗位且未出现严重违约或违法行为，政府部门一般不会随意解除劳动合同。享有长期的劳动关系保障，适合长期稳定的职业发展。
培训与职业发展：
- 劳务派遣工：虽然政府部门可能提供基本工作技能培训，但由于与政府部门无直接隶属关系，劳务派遣工在职业晋升机会、长期培训规划等方面往往不如合同工。
- 合同工：政府部门通常会为合同工制定系统的培训和职业发展规划，提供更多晋升机会和鼓励员工长期发展。合同工可以参与政府部门的内部培训、晋升机会等，有助于个人职业生涯的发展。
解除劳动关系与法律规定：
- 劳务派遣工：政府部门退回被派遣劳动者有严格的法定情形限制；劳务派遣单位解除与劳动者的劳动合同也需遵循法律规定。解除程序因涉及三方关系而相对复杂，劳务派遣单位应与被派遣劳动者订立二年以上的固定期限劳动合同，并与政府部门承担连带赔偿责任。
- 合同工：政府部门与合同工解除劳动合同需符合《劳动合同法》规定的情形，如协商一致解除、劳动者不能胜任工作等。解除程序相对清晰直接，主要是政府部门与劳动者双方之间的事情。
总结与建议：
政府部门劳务派遣工和合同工在法律关系、招聘方式、薪酬福利、职业稳定性、培训与职业发展以及解除劳动关系等多个方面存在显著差异。这些差异直接影响了劳动者的权益和职业发展。因此，在选择就业方式时，劳动者应充分了解并权衡利弊，根据自身需求和职业规划做出明智的选择。
如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。